Metagenomic Identification of Microbial Signatures Predicting Pancreatic Cancer From a Multinational Study
Rattachement africain : jp, de, es. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
BACKGROUND & AIMS: To identify gut and oral metagenomic signatures that accurately predict pancreatic ductal carcinoma (PDAC) and to validate these signatures in independent cohorts. METHODS: We conducted a multinational study and performed shotgun metagenomic analysis of fecal and salivary samples collected from patients with treatment-naïve PDAC and non-PDAC controls in Japan, Spain, and Germany. Taxonomic and functional profiles of the microbiomes were characterized, and metagenomic classifiers to predict PDAC were constructed and validated in external datasets. RESULTS: Comparative metagenomics revealed dysbiosis of both the gut and oral microbiomes and identified 30 gut and 18 oral species significantly associated with PDAC in the Japanese cohort. These microbial signatures achieved high area under the curve values of 0.78 to 0.82. The prediction model trained on the Japanese gut microbiome also had high predictive ability in Spanish and German cohorts, with respective area under the curve values of 0.74 and 0.83, validating its high confidence and versatility for PDAC prediction. Significant enrichments of Streptococcus and Veillonella spp and a depletion of Faecalibacterium prausnitzii were common gut signatures for PDAC in all the 3 cohorts. Prospective follow-up data revealed that patients with certain gut and oral microbial species were at higher risk of PDAC-related mortality. Finally, 58 bacteriophages that could infect microbial species consistently enriched in patients with PDAC across the 3 countries were identified. CONCLUSIONS: Metagenomics targeting the gut and oral microbiomes can provide a powerful source of biomarkers for identifying individuals with PDAC and their prognoses. The identification of shared gut microbial signatures for PDAC in Asian and European cohorts indicates the presence of robust and global gut microbial biomarkers.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Metagenomic Identification of Microbial Signatures Predicting Pancreatic Cancer From a Multinational Study
- Date Crossref
- 01/07/2022
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Tokyo Medical University Department of Gastroenterological Endoscopy pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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National Center for Global Health and Medicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Waseda University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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European Molecular Biology Laboratory Structural and Computational Biology Unit pays non établi dans la noticeOrganisme public
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National Institute of Advanced Industrial Science and Technology pays non établi dans la noticeOrganisme public
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RIKEN Center for Integrative Medical Sciences pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Ezaki Glico (Japan) pays non établi dans la noticeEntreprise
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The University of Tokyo Research Center for Advanced Science and Technology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Spanish National Cancer Research Centre pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Centro de Investigación del Cáncer pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Goethe University Frankfurt pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Department of Gastroenterological Endoscopy — Tokyo Medical University, National Center for Global Health and Medicine et Waseda University, avec 9 autres affiliations.
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