Accès ouvert déclaré
2020
article
HNF4A and GATA6 Loss Reveals Therapeutically Actionable Subtypes in Pancreatic Cancer
Holly Brunton, Giuseppina Caligiuri, Richard N. Cunningham, Rosanna Upstill‐Goddard, Ulla‐Maja Bailey, Ian Garner, Craig Nourse, Stephan B. Dreyer, Marc D. Jones, Kim Moran‐Jones, Derek Wright, Viola Paulus-Hock, Colin Nixon, Gemma Thomson, Nigel Balfour Jamieson, Grant A. McGregor, Lisa Evers, Colin J. McKay, Aditi Gulati, Rachel Brough, Ilirjana Bajrami, Stephen J. Pettitt, Michele L. Dziubinski, Simon T. Barry, Robert Grützmann, Robert Eldon Brown, Edward WJ Curry, Sarah J. Allison, Andrew Victor Biankin, Susanna L. Cooke, Paul Grimwood, Shane Kelly, John Lindsay Marshall, Brian McDade, Daniel L. McElroy, Donna Ramsay, Selma Rebus, Jane Hair, Paul Westwood, Nicola C. Williams, Fraser R. Duthie, Amber L. Johns, Amanda Mawson, David Kuang-Fu Chang, Christopher James Scarlett, Mary-Anne L. Brancato, Sarah J. Rowe, Skye H. Simpson, Mona Martyn-Smith, Michelle T. Thomas, Lorraine A. Chantrill, Venessa Chin, Angela S. Y. Chou, Mark J. Cowley, Jeremy L. Humphris, R. Scott Mead, Adnan M. Nagrial, Marina Pajic, Jessica Pettit, Mark Pinese, Ilse Rooman, Jianmin Wu, Tao Jiang, Renee DiPietro, Clare Watson, Angela M. Steinmann, Hong Ching Lee, Rachel Wong, Andreia V. Pinho, Marc Giry-Laterrière, Roger J. Daly, Robert L. Sutherland, Sean Michael Grimmond, Nicola Waddell, Karin S. Kassahn, David K. Miller, Peter J. Wilson, Ann-Marie Patch, Sarah Song, Ivon Harliwong, Senel Idrisoglu, Ehsan Nourbakhsh, Suzanne S. Manning, Shivangi Wani, Milena Gongora, Matthew J. Anderson, Oliver Holmes, Conrad Leonard, Darrin F. Taylor, Scott Wood, Christina Xu, Kátia Nones, J. Lynn Fink, Angelika N. Christ, Tim Bruxner, Nicole Cloonan, Felicity Newell, John V. Pearson, Michael C. J. Quinn, Shivashankar Hiriyur Nagaraj, Stephen H. Kazakoff, Nick M. Waddell, Keerthana Krisnan, Kelly Quek, David Wood, Jaswinder Singh Samra, Anthony James Gill, Nick Pavlakis, Alex D. Guminski, Christopher W. Toon, Ray Asghari, Neil Donald Merrett, Darren A. Pavey, Amitabha Das, Peter H. Cosman, Kasim Ismail, Chelsie O’Connnor, Vincent W. T. Lam, Duncan J. McLeod, Henry C. C. Pleass, A. J. Richardson, Virginia James, James G. Kench, Caroline Louise Cooper, David John Joseph, Charbel Sandroussi, Michael Crawford, James Gallagher, Michael Texler, Cindy Forest, Andrew Laycock, Krishna P. Epari, Mo Ballal, David R Fletcher, Sanjay Mukhedkar, Nigel A. Spry, Bastiaan DeBoer, Ming G. Chai, Nikolajs Zeps, Maria Beilin, Kynan Feeney, Nan Q. Nguyen, Andrew R. Ruszkiewicz, Chris S. Worthley, Chuan Ping Tan, Tamara Debrencini, John Li Chen, Mark E. Brooke‐Smith, Virginia Papangelis, Henry H. K. Tang, Andrew P. Barbour, Andrew Donald Clouston, Patrick P. Martin, Thomas J. O’Rourke, Amy Chiang, Jonathan W. Fawcett, Kellee Slater, Shinn Yeung, Michael Hatzifotis, Peter Hodgkinson, Christopher Christophi, Mehrdad Nikfarjam, Angela Mountain, James R. Eshleman, Ralph H. Hruban, Anirban Maitra, Christine A. Iacobuzio–Donahue, Richard David Schulick, Christopher Lee Wolfgang, Richard A. Morgan, Mary B. Hodgin, Aldo Scarpa, Rita Teresa Lawlor, Stefania Beghelli, Vincenzo Corbo, Maria Scardoni, Claudio Bassi, Margaret A. Tempero, Janet Shirley Graham, Gloria M. Petersen, Emma J. Shanks, Alan Ashworth, Howard C. Crawford, Diane M. Simeone, Fieke E. M. Froeling, Christopher J. Lord, Debabrata Mukhopadhyay, Christian P. Pilarsky, Sean E. Grimmond, Jennifer P. Morton, Owen James Sansom, Peter J. Bailey
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27Institutions déclarées
5Pays d’affiliation déclarés
Rattachement africain : gb, ch, us, de, au.
Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) can be divided into transcriptomic subtypes with two broad lineages referred to as classical (pancreatic) and squamous. We find that these two subtypes are driven by distinct metabolic phenotypes. Loss of genes that drive endodermal lineage specification, HNF4A and GATA6, switch metabolic profiles from classical (pancreatic) to predominantly squamous, with glycogen synthase kinase 3 beta (GSK3β) a key regulator of glycolysis. Pharmacological inhibition of GSK3β results in selective sensitivity in the squamous subtype; however, a subset of these squamous patient-derived cell lines (PDCLs) acquires rapid drug tolerance. Using chromatin accessibility maps, we demonstrate that the squamous subtype can be further classified using chromatin accessibility to predict responsiveness and tolerance to GSK3β inhibitors. Our findings demonstrate that distinct patterns of chromatin accessibility can be used to identify patient subgroups that are indistinguishable by gene expression profiles, highlighting the utility of chromatin-based biomarkers for patient selection in the treatment of PDAC.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- HNF4A and GATA6 Loss Reveals Therapeutically Actionable Subtypes in Pancreatic Cancer
- Date Crossref
- 01/05/2020
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Cancer Research UK
pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
-
Cancer Research UK Scotland Institute
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Structure de recherche
-
University of Glasgow
Institute of Cancer Sciences
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Université ou école supérieure
-
Switch
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Organisation à but non lucratif
-
Imperial College London
Department of Surgery & Cancer
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Université ou école supérieure
-
Glasgow Royal Infirmary
pays non établi dans la notice
Établissement de santé
-
Queen Elizabeth University Hospital
Stratified Medicine Scotland Innovation Centre
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Établissement de santé
-
MRC University of Glasgow Centre for Virus Research
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Organisme public
-
Institute of Cancer Research
pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
-
Breast Cancer Now
pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
-
University of Michigan
Department of Molecular and Integrative Physiology
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Université ou école supérieure
-
U-M Rogel Cancer Center
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Établissement de santé
Cancer Research UK, Cancer Research UK Scotland Institute et Institute of Cancer Sciences — University of Glasgow, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.
Les sujets associés
Pancreatic and Hepatic Oncology ResearchEpigenetics and DNA MethylationNeuroendocrine Tumor Research Advances