Spatial colocalization of neoantigen-expressing tumor cells and cognate T cells in cancer 2309241
Adi Nagler, Amit Sud, Jack Ghannam, Lucas Pomerance et autres
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The Journal of Immunology
Vipin Kumar
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Advanced biosensing and bioanalysis techniquesDNA and Nucleic Acid ChemistryRNA Interference and Gene DeliverySingle-cell and spatial transcriptomicsRNA and protein synthesis mechanisms
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Single-nucleus multimodal spatial transcriptomics reveals spatial colocalization of neoantigen-expressing tumor cells and cognate T cells
Adi Nagler, Amit Sud, Jack Ghannam, Lucas Pomerance et autres
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Nature Biotechnology
Codebase for "Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumour growth and metastasis"
Matthew G. Jones, Dawei Sun, Kyung Hoi Min, William Colgan et autres
us, il (code pays fourni par la source)
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Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
Codebase for "Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumour growth and metastasis"
Matthew G. Jones, Dawei Sun, Kyung Hoi Min, William Colgan et autres
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Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
Aging disrupts spatiotemporal coordination in the cycling murine ovary
Tammy C. T. Lan, Alison Kochersberger, Ruth Raichur, Sophia Szady et autres
us, at (code pays fourni par la source)
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Nature Aging
Pyramidal neurons proportionately alter cortical interneuron subtypes
Sherry Jingjing Wu, Min Dai, Shang-Po Yang, Cai McCann et autres
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Nature
JASPAR 2026: expansion of transcription factor binding profiles and integration of deep learning models
Damla Ovek, Ieva Rauluševičiūtė, Dina Ruud Aronsen, Romain Blanc‐Mathieu et autres
no, fr, be, us, ca, gb, hr, ae, fi, dk (code pays fourni par la source)
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Nucleic Acids Research
Scalable spatial transcriptomics through computational array reconstruction
Chenlei Hu, Mehdi Borji, Giovanni Marrero, Vipin Kumar et autres
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Nature Biotechnology
In silico Design, Synthesis and Biological Evaluation of Novel Chalcone Derivatives as Potent Tubulin-Targeting Anticancer Agents
Kailash Rani, Vipin Kumar, Rakesh K. Sindhu, Somdutt Mujwar
in, us (code pays fourni par la source)
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Asian Journal of Chemistry
Aging disrupts spatiotemporal coordination in the cycling murine ovary
Tammy C. T. Lan, Alison Kochersberger, Ruth Raichur, Sophia Szady et autres
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Improving bioinformatics software quality through teamwork
Katalin Ferenc, Ieva Rauluševičiūtė, Ladislav Hovan, Vipin Kumar et autres
no (code pays fourni par la source)
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Bioinformatics
Scalable imaging-free spatial genomics through computational reconstruction
Chenlei Hu, Mehdi Borji, Giovanni Marrero, Vipin Kumar et autres
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
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