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Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
Adrian Altenhoff
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Genomics and Phylogenetic StudiesBioinformatics and Genomic NetworksMachine Learning in BioinformaticsBiomedical Text Mining and OntologiesRNA and protein synthesis mechanisms
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OMA Browser Datasets
Adrian Altenhoff, Christophe Dessimoz, Natasha Glover
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Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
OMA Browser Datasets
Adrian Altenhoff, Christophe Dessimoz, Natasha Glover
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Zenodo (CERN European Organization for Nuclear Research)
On the state of protein function prediction: a report on the fourth CAFA challenge
Rashika Ramola, M. Clara De Paolis Klauza, Damiano Piovesan, Yisu Peng et autres
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
PhytClust: Efficient and Optimal Monophyletic Partitioning of Rooted Phylogenetic Trees
Katyayni Ganesan, Elisa Billard, Tom L. Kaufmann, Adrian Altenhoff et autres
us, de, ch (code pays fourni par la source)
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
OrthoXML-Tools: A Toolkit for Manipulating OrthoXML Files for Orthology Data
Ali Yazdizadeh Kharrazi, Adrian Altenhoff, Nikolai Romashchenko, Christophe Dessimoz et autres
nl, ch, us (code pays fourni par la source)
3 citations
Journal of Molecular Evolution
EdgeHOG: a method for fine-grained ancestral gene order inference at large scale
Charles Bernard, Yannis Nevers, Naga Bhushana Rao Karampudi, Kimberly J. Gilbert et autres
ch, fr, us, in (code pays fourni par la source)
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Nature Ecology & Evolution
Annotation matters: the effect of structural gene annotation on orthology inference
Silvia Prieto-Baños, Yannis Nevers, Adrian Altenhoff, Alex Warwick Vesztrocy et autres
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17 citations
Bioinformatics
Orthology inference at scale with FastOMA
Sina Majidian, Yannis Nevers, Ali Yazdizadeh Kharrazi, Alex Warwick Vesztrocy et autres
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25 citations
Nature Methods
A large collection of bioinformatics question–query pairs over federated knowledge graphs: methodology and applications
Jerven Bolleman, Vincent Emonet, Adrian Altenhoff, Amos Bairoch et autres
ch (code pays fourni par la source)
3 citations
GigaScience
A large collection of bioinformatics question-query pairs over federated knowledge graphs: methodology and applications
Jerven Bolleman, Vincent Emonet, Adrian Altenhoff, Amos Bairoch et autres
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arXiv (Cornell University)
EdgeHOG: fine-grained ancestral gene order inference at tree-of-life scale
Charles Bernard, Yannis Nevers, Naga Bhushana Rao Karampudi, Kimberly J. Gilbert et autres
fr, ch, in (code pays fourni par la source)
1 citation
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
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