Single-cell transcriptional dynamics in a living vertebrate
Elizabeth Eck, Bruno Moretti, Brandon H. Schlomann, Jordão Bragantini et autres
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Cell Systems
Shruthi VijayKumar
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Single-cell and spatial transcriptomicsAdvanced Fluorescence Microscopy TechniquesCell Image Analysis TechniquesRNA Research and SplicingZebrafish Biomedical Research Applications
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In vivo reconstruction of the cell lineage history of a developing mouse with DNA Typewriter, from zygote to late organogenesis
Qi Yu, Haedong Kim, Sophie Seidel, James F. Clark et autres
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Ultrack: pushing the limits of cell tracking across biological scales
Jordão Bragantini, Ilan Theodoro, Xiang Zhao, Teun A.P.M. Huijben et autres
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Nature Methods
A multimodal zebrafish developmental atlas reveals the state-transition dynamics of late-vertebrate pluripotent axial progenitors
Merlin Lange, Alejandro A. Granados, Shruthi VijayKumar, Jordão Bragantini et autres
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Cell
Zebrahub-Multiome: Uncovering Gene Regulatory Network Dynamics During Zebrafish Embryogenesis
Yang Joon Kim, Shruthi VijayKumar, Benjamin Giovanni Iovino, Alejandro A. Granados et autres
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Maximizing single cell dissociation protocol for individual zebrafish embryo
Shruthi VijayKumar, Michael Borja, Norma Neff, Löıc A. Royer et autres
us (code pays fourni par la source)
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MethodsX
Ultrack: pushing the limits of cell tracking across biological scales
Jordão Bragantini, Ilan Theodoro, Xiang Zhao, Teun A.P.M. Huijben et autres
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21 citations
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Zebrahub – Multimodal Zebrafish Developmental Atlas Reveals the State-Transition Dynamics of Late-Vertebrate Pluripotent Axial Progenitors
Merlin Lange, Alejandro A. Granados, Shruthi VijayKumar, Jordão Bragantini et autres
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70 citations
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
DaXi—high-resolution, large imaging volume and multi-view single-objective light-sheet microscopy
Bin Yang, Merlin Lange, Alfred Millett-Sikking, Xiang Zhao et autres
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Nature Methods
Zebrahub single cell dataset
Merlin Lange, Alejandro A. Granados, Shruthi VijayKumar, Michael Borja et autres
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A biallelic variant in CLRN2 causes non-syndromic hearing loss in humans
Barbara Vona, Neda Mazaheri, Sheng‐Jia Lin, Lucy A Dunbar et autres
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Human Genetics
Biallelic mutation of CLRN2 causes non-syndromic hearing loss in humans
Barbara Vona, Neda Mazaheri, Sheng‐Jia Lin, Lucy A Dunbar et autres
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3 citations
bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
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