A high-density CRISPR activation platform for mapping cancer dependencies and resistance pathways ex vivo and in vivo
Rattachement africain : au, cn. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
CRISPR activation (CRISPRa) enables precise up-regulation of gene expression for ex vivo and in vivo applications. However, a lack of scalable, high-coverage tools has limited comprehensive genetic screening in murine models. Here, we introduce Partita, a next-generation mouse whole-genome CRISPRa sgRNA platform, designed for unparalleled efficiency in gene activation studies. Partita uses a high-density targeting strategy, deploying 10 sgRNAs per transcriptional start site, structured into five gene class-specific sublibraries to maximize transcriptional induction. To demonstrate the capabilities of Partita, we performed a series of large-scale screens: an in vitro enrichment/depletion screen, whole-genome CRISPRa screens in a double-hit lymphoma model to uncover resistance factors to proapoptotic drugs (venetoclax, nutlin-3a, and etoposide) and an in vivo screen to identify accelerators of MYC-driven lymphomagenesis. Each experiment revealed both expected and unexpected regulators, with high validation rates. By enabling robust gain-of-function screening, Partita unlocks new avenues for functional genomics and expands the toolkit for discovering key drivers of biological processes across diverse research fields.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- A high-density CRISPR activation platform for mapping cancer dependencies and resistance pathways ex vivo and in vivo
- Date Crossref
- 18/09/2026
- Éditeur
- American Association for the Advancement of Science (AAAS)
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
The University of Melbourne Department of Medical Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
La Trobe University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Olivia Newton-John Cancer Wellness & Research Centre pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
Olivia Newton-John Cancer Research Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
Nanjing University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
School of Cancer Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
School of Life Sciences The State Key Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Genentech Inc. Department of Molecular Biology pays non établi dans la noticeEntreprise
Department of Medical Biology — The University of Melbourne, Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research et La Trobe University, avec 6 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.