Spatial multi-omics and single-cell transcriptomics uncover senescence-associated cellular programs during colon adenoma to cancer progression
Rattachement africain : Afrique du Sud, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract Colorectal cancer develops through a normal-adenoma-carcinoma sequence, yet only 5-10% of adenomas progress to malignancy, and the cellular programs governing that sequence remain poorly defined. Here we generate a spatial multi-omics atlas of human colon adenomas, combining Visium CytAssist and protein co-detection across 24 nonadvanced and advanced tubular adenomas with single-cell resolution Xenium Prime 5K profiling of 101 patient-matched normal, adenoma, and carcinoma cores from 16 patients. Integrating whole-transcriptome and 31-plex protein data identifies nine spatial clusters and two dysplastic epithelial populations that co-express stemness, proliferation, and senescence programs. These programs occupy a shared, spatially confined epithelial niche that expands from adenoma to carcinoma. Spatial analysis revealed GDF15, a senescence-associated secretory factor, mediated the coupling between senescence and stemness in advanced adenomas, and that GDF15-high epithelium locally excludes CD8+ T cells in adenoma and, more broadly, in carcinoma. These findings position senescence as a spatially instructive rather than merely tumor-suppressive program during colorectal carcinogenesis and suggest GDF15 might be a potential candidate target for cancer prevention and interception in the colon. Statement of Significance Spatial multi-omics identifies spatially co-localized senescence and stemness programs in dysplastic epithelium during colorectal tumorigenesis and links GDF15-associated niches to CD8-positive T-cell exclusion, nominating GDF15 for colorectal cancer prevention and interception strategies. Conflicts of interests The authors declare the following competing interests: W.M.G.: Consulting for Guardant Health, Research support from Lucid Diagnostics; E.W.N.: Co-founder, advisor, and shareholder of ImmunoScape. All the other authors declare no competing interests.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Spatial multi-omics and single-cell transcriptomics uncover senescence-associated cellular programs during colon adenoma to cancer progression
- Date Crossref
- 07/08/2026
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Cape Town HVTN Immunology Laboratory / Hutchinson Centre Research Institute of South Africa Cape Town, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)Organisation à but non lucratif
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Fred Hutch Cancer Center pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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University of Wisconsin–Madison pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Mayo Clinic in Arizona pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Johns Hopkins University Department of Pathology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Johns Hopkins Medicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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University of Washington Department of Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Translational Sciences and Therapeutics pays non établi dans la noticeInstitution
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University of Wisconsin-Madison Department of Biostatistics and Medical Informatics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Vaccine and Infectious Disease Division pays non établi dans la noticeInstitution
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Biostatistics Program pays non établi dans la noticeInstitution
Cape Town HVTN Immunology Laboratory / Hutchinson Centre Research Institute of South Africa (Cape Town, Afrique du Sud), Fred Hutch Cancer Center et University of Wisconsin–Madison, avec 8 autres affiliations. Pays d’affiliation : Afrique du Sud.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.