A generalizable interface-seeded framework for de novo design of functional oligomers
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Le résumé fourni par la source
Abstract Protein oligomers are ubiquitous in biological systems and essential for function. However, the de novo design of oligomers that controllably assemble in response to exogenous stimuli remains challenging. Here, we present an AI-based generative approach that leverages an interface-seeded strategy for designing responsive homo-oligomers from isolated interaction modules. Experimentally validated designs are highly accurate and explore new-to-nature topologies. We show that designs effectively respond to their chemical triggers with conditional oligomerization or to phosphorylation-driven conformational changes with reversible oligomerization. We further functionalized our responsive assemblies to build ligand-dependent membrane binding systems and phosphorylation-controlled gene regulatory switches. Our framework enables the generalizable design of responsive protein complexes, opening novel possibilities for the engineering of biosynthetic systems with sophisticated regulatory mechanisms.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- A generalizable interface-seeded framework for <i>de novo</i> design of functional oligomers
- Date Crossref
- 03/07/2026
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
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Où se fait cette recherche
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Ludwig-Maximilians-Universität München pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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École Polytechnique Fédérale de Lausanne Laboratory of Protein Design and Immunoengineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Leipzig University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Center for Scalable Data Analytics and Artificial Intelligence pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Ludwig Maximilian University of Munich Department of Physical Chemistry pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Faculty of Medicine Department of Pharmaceutical Chemistry pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Life Sciences Protein Production and Structure Core Facility pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Ludwig-Maximilians-Universität München, Laboratory of Protein Design and Immunoengineering — École Polytechnique Fédérale de Lausanne et Leipzig University, avec 4 autres affiliations.
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