Accès ouvert déclaré 2025 preprint

Stochastically Emergent Tumors offer in vivo whole genome interrogation of cancer evolution from non-malignant precursors

Ruhollah Moussavi-Baygi, Matthew J. Ryan, Woogwang Sim, Samuel B. Hoelscher, Valbona Luga, Arun A. Chandrakumar, Junghwa Cha, Young Sun Lee, Katelyn Herm, Ben Doron, Chuanbo Ding, Bradley A. Stohr, Jin Peng, Tejasveeta Nadkarni, Xiangyi Fang, Melita Haryono, An H. Nguyen, Wouter R. Karthaus, Charles L. Sawyers, Felix Yi-Chung Feng, Hani Goodarzi, Rohit Bose

1Citations signalées, ce qui n’est pas une note de qualité

5Institutions déclarées

2Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : us, ch. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Interrogating the stochastic events underlying tumor evolution from non-malignant precursors is crucial for understanding therapy resistance. Current methods are complicated by chromosomal instability, obscuring driver identification and yielding non-representative genetics. Inspired by patient tumors that evolve without chromosomal instability, we developed Stochastically Emergent Tumors (SETs) by inducing mismatch repair deficiency in non-malignant precursors, then engrafting in mice. Barcoded SETs exhibited increased tumoral and drug target heterogeneity over current models. SETs delineated the stochastic contributions, mutational landscapes, and selective pressures distinguishing tumorigenesis from non-malignant precursor in vitro growth. SETs are an unlimited source for diverse Stochastically Emergent cell Lines (SELs), bolstering under-represented cancers. Since SETs composition dynamically reflects therapy exposure, they are a whole-genome platform for precision oncology. We identified three novel genetic drivers (ZFHX3, CIC, KMT2D) of differential prostate cancer therapy responses. These alterations are enriched in patients of African and Chinese ancestry and correlate with significant differences in survival.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref: Stochastically Emergent Tumors offer in vivo whole genome interrogation of cancer evolution from non-malignant precursors
Date Crossref: 18/03/2025
Éditeur: openRxiv
Type: posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

University of California pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Motlow State Community College pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Caris Life Sciences (United States) pays non établi dans la notice
Entreprise
Swiss Group For Clinical Cancer Research pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
École Polytechnique Fédérale de Lausanne pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
UCSF pays non établi dans la notice
Institution
MSKCC pays non établi dans la notice
Institution
Swiss Institute for Experimental Cancer Research (ISREC) pays non établi dans la notice
Structure de recherche

University of California, Motlow State Community College et Caris Life Sciences (United States), avec 5 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

Cancer Genomics and DiagnosticsGenetic factors in colorectal cancerRNA Research and Splicing

Lire en accès ouvert Consulter la publication primaire Ouvrir le DOI