RET Alterations Differentiate Molecular Profile of Medullary Thyroid Cancer
Rattachement africain : in. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
PURPOSE Medullary thyroid cancer (MTC) is a rare cancer originating from parafollicular C cells of the thyroid gland. Therapeutically relevant alterations in MTC are predominantly reported in RET oncogene, and lower-frequency alterations are reported in KRAS and BRAF . Nevertheless, there is an unmet need existing to analyze the MTC in the Indian cohort by using in-depth sequencing techniques that go beyond the identification of known therapeutic biomarkers. MATERIALS AND METHODS Here, we characterize MTC using integrative whole-exome and whole-transcriptome sequencing of 32 MTC tissue samples. We performed clinically relevant variant analysis, molecular pathway analysis, tumor immune-microenvironment analysis, and structural characterization of RET novel mutation. RESULTS Mutational landscape analysis shows expected RET mutations in 50% of the cases. Furthermore, we observed mutations in known cancer genes like KRAS , HRAS , SF3B1 , and BRAF to be altered only in the RET -negative cohort. Pathway analysis showed differential enrichment of mutations in transcriptional deregulation genes in the RET -negative cohort. Furthermore, we observed novel RET kinase domain mutation Y900S showing affinity to RET inhibitors accessed via molecular docking and molecular dynamics simulation. CONCLUSION Altogether, this study provides a detailed genomic characterization of patients with MTC of Indian origin, highlighting the possible utility of targeted therapies in this disease.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- <i>RET</i> Alterations Differentiate Molecular Profile of Medullary Thyroid Cancer
- Date Crossref
- 01/11/2024
- Éditeur
- American Society of Clinical Oncology (ASCO)
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Homi Bhabha National Institute pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Tata Memorial Hospital Department of Medical Oncology pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Advanced Centre for Treatment pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Institute of Bioinformatics and Applied Biotechnology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Bioinformatics and Crosstalk Laboratory Computational Biology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Medical Oncology Molecular Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Integrated Cancer Genomics Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Homi Bhabha National Institute, Department of Medical Oncology — Tata Memorial Hospital et Advanced Centre for Treatment, avec 4 autres affiliations.
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