“Identification of microRNAs regulated by E2F transcription factors in human pluripotent stem cells”
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Le résumé fourni par la source
ABSTRACT Human pluripotent stem cells (hPSCs), which include embryonic and induced pluripotent stem cells (hESCs and hiPSCs, respectively), have an unusual cell cycle structure which consists of a short G1 phase and the absence of the G1/S checkpoint regulation. E2F transcription factors (E2Fs) play an important role in the G1/S transition. G1 duration contributes to hPSC fate determination, and microRNAs (miRNAs) play critical roles in this commitment. As little is known about the interplay between E2Fs and miRNAs in hPSCs, we aimed to identify miRNAs that are regulated by E2Fs in these cells. We first found that mRNA expression levels of canonical E2F repressors were more expressed than most E2F activators in G1-arrested hPSCs. Moreover, we observed higher mRNA and protein expression levels of canonical E2F2 , E2F3A, and E2F5 in G1 synchronized hPSCs compared to human fibroblasts (HF). However, E2F1 and E2F4 protein expression levels were higher in HF. We next found that E2F inhibition with HLM006474 induced an increase in the G1 cell population without affecting hPSC viability, concomitantly with a decrease in OCT-4 mRNA levels and the percentage of OCT-4 + hPSCs. Next, by RNA-seq analysis we found 52 differentially expressed (DEGs) miRNAs in HLM006474-treated hESCs. RT-qPCR validation of some of the DEGs let us conclude that miR-19a-3p, miR-19b-3p, miR-4454, miR-1260a, miR-1260b, miR-454-3p and miR-301a-3p are regulated by E2Fs in hPSCs. Interestingly, gene target and ontology analysis of these miRNAs revealed a possible implication in proliferation and cell cycle regulation, development, and neural differentiation.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- “Identification of microRNAs regulated by E2F transcription factors in human pluripotent stem cells”
- Date Crossref
- 02/03/2024
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Universidad Nacional de Córdoba pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Instituto de Neurociencias (INEU-CONICET) Laboratorios de Investigación Aplicada en Neurociencias (LIAN) pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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DataLab pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Facultad de Ciencias Exactas pays non établi dans la noticeInstitution
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas, Fundación para la Lucha contra las Enfermedades Neurológicas de la Infancia et Universidad Nacional de Córdoba, avec 3 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.