Molecular Epidemiology of Human Metapneumovirus in East Japan before and after COVID-19, 2017–2022
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Le résumé fourni par la source
Human metapneumovirus (hMPV) is genetically classified into two major subgroups, A and B, based on attachment glycoprotein (G) gene sequences, and the A2 subgroup is further separated into three subdivisions A2a, A2b (A2b1), and A2c (A2b2). The appearance of subgroup A2c viruses carrying a 180- or 111-nucleotide duplication in the G gene (A2c180nt-dup or A2c111nt-dup) have been reported in Japan and Spain. The pandemic of coronavirus disease 2019 (COVID-19) disrupted the epidemiological kinetics of other respiratory viruses, including hMPV. In this study, we analysed the sequences of hMPV isolates obtained from 2017 to 2022 in Tokyo and Fukushima, i.e., before and after COVID-19. Subgroup A hMPVs were detected in 2017 to 2019, and most cases were A2c111nt-dup, suggesting there was continuous momentum of this clade, identical to the global situation. Subgroup B, but not subgroup A, viruses were detected in 2022, after the COVID-19 peak. Phylogenetic analysis showed that these resumed subgroup B viruses were closely related to the viruses detected in 2013 to 2016 in Yokohama and in 2019 in Fukushima, suggesting a reappearance of local endemic viruses in East Japan.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Molecular Epidemiology of Human Metapneumovirus in East Japan before and after COVID-19, 2017–2022
- Date Crossref
- 31/05/2024
- Éditeur
- Editorial Committee of Japanese Journal of Infectious Diseases, National Institute of Infectious Dis
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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National Institute of Infectious Diseases Department of Virology III pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Hokkaido University International Institute for Zoonosis Control pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Fukushima Medical University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Star General Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Seirei Hamamatsu General Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Ohara General Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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The University of Tokyo pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Laboratory Animals Management Department of Biosafety pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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School of Medicine Department of Pediatrics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hoshi General Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
Department of Virology III — National Institute of Infectious Diseases, International Institute for Zoonosis Control — Hokkaido University et Fukushima Medical University, avec 7 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.