A global genetic interaction network by single-cell imaging and machine learning
Rattachement africain : de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Cellular and organismal phenotypes are controlled by complex gene regulatory networks. However, reference maps of gene function are still scarce across different organisms. Here, we generated synthetic genetic interaction and cell morphology profiles of more than 6,800 genes in cultured Drosophila cells. The resulting map of genetic interactions was used for machine learning-based gene function discovery, assigning functions to genes in 47 modules. Furthermore, we devised Cytoclass as a method to dissect genetic interactions for discrete cell states at the single-cell resolution. This approach identified an interaction of Cdk2 and the Cop9 signalosome complex, triggering senescence-associated secretory phenotypes and immunogenic conversion in hemocytic cells. Together, our data constitute a genome-scale resource of functional gene profiles to uncover the mechanisms underlying genetic interactions and their plasticity at the single-cell level.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- A global genetic interaction network by single-cell imaging and machine learning
- Date Crossref
- 01/05/2023
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
TH Bingen University of Applied Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
German Cancer Research Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Heidelberg University Center of Organismal Studies pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
University Hospital Heidelberg pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
DKFZ-ZMBH Alliance pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Medical Faculty Mannheim German Cancer Research Center (DKFZ) pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
University of Applied Sciences Bingen Department of Life Sciences and Engineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
TH Bingen University of Applied Sciences, German Cancer Research Center et Center of Organismal Studies — Heidelberg University, avec 4 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.