Automated reconstruction of whole-embryo cell lineages by learning from sparse annotations
Rattachement africain : us, de, fr, gb, ch. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
We present a method to automatically identify and track nuclei in time-lapse microscopy recordings of entire developing embryos. The method combines deep learning and global optimization. On a mouse dataset, it reconstructs 75.8% of cell lineages spanning 1 h, as compared to 31.8% for the competing method. Our approach improves understanding of where and when cell fate decisions are made in developing embryos, tissues, and organs.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Automated reconstruction of whole-embryo cell lineages by learning from sparse annotations
- Date Crossref
- 05/09/2022
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Howard Hughes Medical Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Janelia Research Campus pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Max Delbrück Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Humboldt-Universität zu Berlin pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Laboratoire d’Informatique et Systèmes pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Living Systems (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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MRC Laboratory of Molecular Biology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of Basel Biozentrum pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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HHMI Janelia pays non établi dans la noticeInstitution
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Faculty of Mathematics and Natural Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Aix Marseille University CNRS pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Howard Hughes Medical Institute, Janelia Research Campus et Max Delbrück Center, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.