Fifteen Shades of Grey: Combined Analysis of Genome-Wide SNP Data in Steppe and Mediterranean Grey Cattle Sheds New Light on the Molecular Basis of Coat Color
Rattachement africain : it, Algérie, hu, tr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Coat color is among the most distinctive phenotypes in cattle. Worldwide, several breeds share peculiar coat color features such as the presence of a fawn pigmentation of the calf at birth, turning over time to grey, and sexual dichromatism. The aim of this study was to search for polymorphisms under differential selection by contrasting grey cattle breeds displaying the above phenotype with non-grey cattle breeds, and to identify the underlying genes. Using medium-density SNP array genotype data, a multi-cohort FST-outlier approach was adopted for a total of 60 pair-wise comparisons of the 15 grey with 4 non-grey cattle breeds (Angus, Limousin, Charolais, and Holstein), with the latter selected as representative of solid and piebald phenotypes, respectively. Overall, more than 50 candidate genes were detected; almost all were either directly or indirectly involved in pigmentation, and some of them were already known for their role in phenotypes related with hair graying in mammals. Notably, 17 relevant genes, including SDR16C5, MOS, SDCBP, and NSMAF, were located in a signal on BTA14 convergently observed in all the four considered scenarios. Overall, the key stages of pigmentation (melanocyte development, melanogenesis, and pigment trafficking/transfer) were all represented among the pleiotropic functions of the candidate genes, suggesting the complex nature of the grey phenotype in cattle.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Fifteen Shades of Grey: Combined Analysis of Genome-Wide SNP Data in Steppe and Mediterranean Grey Cattle Sheds New Light on the Molecular Basis of Coat Color
- Date Crossref
- 13/08/2020
- Éditeur
- MDPI AG
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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University of Molise Ambiente e Alimenti pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Bari Aldo Moro Biotecnologie e Biofarmaceutica pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Palermo Alimentari e Forestali pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Abou Bekr Belkaïd Algérie (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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University of Catania pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Debrecen Animal Genetics Laboratory pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Akdeniz University Department of Animal Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University Abou Bekr Bélkaid Department of Biology Tlemcen, Algérie (pays nommé en fin d’affiliation)Université ou école supérieure
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Dipartimento di Agricoltura pays non établi dans la noticeInstitution
Ambiente e Alimenti — University of Molise, Biotecnologie e Biofarmaceutica — University of Bari Aldo Moro et Alimentari e Forestali — University of Palermo, avec 6 autres affiliations. Pays d’affiliation : Algérie.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.