Tales of diversity: Genomic and morphological characteristics of forty-six Arthrobacter phages
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Le résumé fourni par la source
The vast bacteriophage population harbors an immense reservoir of genetic information. Almost 2000 phage genomes have been sequenced from phages infecting hosts in the phylum Actinobacteria, and analysis of these genomes reveals substantial diversity, pervasive mosaicism, and novel mechanisms for phage replication and lysogeny. Here, we describe the isolation and genomic characterization of 46 phages from environmental samples at various geographic locations in the U.S. infecting a single Arthrobacter sp. strain. These phages include representatives of all three virion morphologies, and Jasmine is the first sequenced podovirus of an actinobacterial host. The phages also span considerable sequence diversity, and can be grouped into 10 clusters according to their nucleotide diversity, and two singletons each with no close relatives. However, the clusters/singletons appear to be genomically well separated from each other, and relatively few genes are shared between clusters. Genome size varies from among the smallest of siphoviral phages (15,319 bp) to over 70 kbp, and G+C contents range from 45-68%, compared to 63.4% for the host genome. Although temperate phages are common among other actinobacterial hosts, these Arthrobacter phages are primarily lytic, and only the singleton Galaxy is likely temperate.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Tales of diversity: Genomic and morphological characteristics of forty-six Arthrobacter phages
- Date Crossref
- 17/07/2017
- Éditeur
- Public Library of Science (PLoS)
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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University of Wisconsin–River Falls pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Pittsburgh Department of Biological Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Baylor University Department of Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Cabrini University Department of Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Western Kentucky University Biology Department pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of North Texas Department of Biological Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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The Ohio State University Center for Life Sciences Education pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Saint Joseph's University Biology Department pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Bucknell University Biology Department pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Carnegie Mellon University Department of Biological Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Lehigh University Biological Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Wisconsin-River Falls Biology Department pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
University of Wisconsin–River Falls, Department of Biological Sciences — University of Pittsburgh et Department of Biology — Baylor University, avec 9 autres affiliations.
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