Formation of an RNA-mediated nuclear compartment
Denis L. Lafontaine, Ezequiel Calvo-Roitberg, Yu-Chieh Chung, Liyan Yang et autres
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Job Dekker
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Genomics and Chromatin DynamicsChromosomal and Genetic VariationsRNA Research and SplicingRNA and protein synthesis mechanismsEpigenetics and DNA Methylation
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Histone Acetylation Differentially Modulates CTCF-CTCF Loops and Intra-TAD Interactions
Rebecca G. Smith, Y. Fu, Kathleen L Schiela, Madison Dautle et autres
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Nature Communications
UnionLoops: a workflow for calling chromatin loops across related Hi-C datasets with improved specificity, precision, and sensitivity
Jiangyuan Liu, Johan H. Gibcus, Job Dekker
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Genome biology
Additional file 2 of UnionLoops: a workflow for calling chromatin loops across related Hi-C datasets with improved specificity, precision, and sensitivity
Jiangyuan Liu, Johan H. Gibcus, Job Dekker
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Additional file 1 of UnionLoops: a workflow for calling chromatin loops across related Hi-C datasets with improved specificity, precision, and sensitivity
Jiangyuan Liu, Johan H. Gibcus, Job Dekker
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Jiangyuan Liu, Johan H. Gibcus, Job Dekker
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An integrated view of the structure and function of the human 4D nucleome
Job Dekker, Betül Akgöl Oksuz, Yang Zhang, Ye Wang et autres
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Nature
mRNA initiation and termination are spatially coordinated
Ezequiel Calvo-Roitberg, Christine L. Carroll, Gyeungyun Kim, Valeria C. Sanabria et autres
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Science
Dynamic changes in chromosome and nuclear architecture during maturation of normal and ALS C9orf72 motor neurons
Özgün Uyan, Snehal Sambare, Marlies E. Oomen, Nicholas Wightman et autres
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
esBAF and INO80C fine-tune subcompartments and differentially regulate enhancer-promoter interactions
Braulio Bonilla, Benjamin J. Patty, Snehal Sambare, Job Dekker et autres
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bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Mitotic chromosomes harbor cell type– and species-specific structural features within a universal loop array conformation
Marlies E. Oomen, A. Nicole Fox, Inma González, Amandine Molliex et autres
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Genome Research
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