Spatial proteomic profiling reveals an association between NF1-Ras/Raf/MEK signaling and immune cell infiltration in locally advanced triple-negative breast cancer
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BACKGROUND: Triple-negative breast cancer (TNBC) is a highly aggressive malignancy characterized by significant molecular heterogeneity with a limited range of targeted therapy options. Better resolution of the spatial interactions between tumor cells and the immune microenvironment is essential for identifying actionable vulnerabilities. METHODS: Here we employed GeoMx Digital Spatial Profiling (DSP) to investigate the proteomic landscape of 72 immuno-oncology biomarkers in normal breast, primary breast cancer, and metastatic axillary lymph node tissues of treatment-naïve TNBC patients (n=29) who underwent upfront breast surgery. RESULTS: Through comprehensive profiling, we identified the tumor suppressor protein, neurofibromin (NF1), as one of the vulnerabilities in TNBC. Spatially resolved analysis revealed that NF1 downregulation is strongly associated with Ras/Raf/MEK pathway activation. This downregulation of NF1 level was characteristic of tumor regions with a high representation of tumor infiltrating lymphocytes (TILs). Furthermore, low NF1 levels significantly correlated with reduced disease-free survival, suggesting its potential clinical utility as a biomarker. We also observed a high degree of proteomic similarity between primary breast tumors and the matched lymph node metastases. CONCLUSIONS: These findings advance our understanding of TNBC spatial proteomic profiles and suggest that targeting the NF1-Ras/Raf/MEK axis may offer novel strategy for clinical management of TNBC patients with immune "hot" tumors.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- Spatial proteomic profiling reveals an association between NF1-Ras/Raf/MEK signaling and immune cell infiltration in locally advanced triple-negative breast cancer
- Date Crossref
- 01/10/2026
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Western University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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London Health Sciences Centre Verspeeten Family Cancer Centre pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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London Health Sciences Centre Research Institute pays non établi dans la noticeOrganisme public
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St Joseph's Health Care pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Schulich School of Medicine & Dentistry Department of Anatomy and Cell Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Schulich School of Medicine and Dentistry Department of Pathology and Laboratory Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Bruker Spatial Biology pays non établi dans la noticeInstitution
Western University, Verspeeten Family Cancer Centre — London Health Sciences Centre et London Health Sciences Centre Research Institute, avec 4 autres affiliations.
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