Alternative to invasive bronchoscopy: validating tracheal aspirates for microbiome profiling in intensive care unit pneumonia patients
Rattachement africain : us, kr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Pneumonia causes significant mortality in intensive care unit (ICU) patients, yet traditional culture-based pathogen detection lacks sufficient sensitivity. While bronchoalveolar lavage fluid (BAL) provides optimal diagnostic yield, bronchoscopy is often contraindicated in critically ill patients. This study compares the respiratory microbiome profiles of paired tracheal aspirate (ETA) and BAL samples from pneumonia patients in a tertiary hospital ICU (n=23, November 2019-September 2022). Using 16S rRNA next-generation sequencing, we analyzed microbial diversity (Shannon Index), taxonomic composition, and differential abundance (edgeR). Results showed comparable diversity indices and microbial communities between ETA and BAL samples, with ETA successfully capturing key pneumonia-related microbial signatures. These findings validate ETA as a reliable, less invasive alternative to BAL for respiratory microbiome analysis in critically ill patients, establishing the groundwork for future clinical applications.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Alternative to invasive bronchoscopy: validating tracheal aspirates for microbiome profiling in intensive care unit pneumonia patients
- Date Crossref
- 17/07/2026
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Florida International University Bioinformatics Research Group (BioRG) pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Chungbuk National University Hospital Department of Internal Medicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Chungbuk National University Medical Research Center pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Euleris.AI LLC pays non établi dans la noticeInstitution
Bioinformatics Research Group (BioRG) — Florida International University, Department of Internal Medicine — Chungbuk National University Hospital et Medical Research Center — Chungbuk National University, avec 1 autre affiliation.
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