The 12 o’clock assay: an optimized dodecaplex droplet digital PCR assay for robust DNA methylation quantification and epigenetic clock-based age-predictions
Rattachement africain : fr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract DNA methylation quantification in age-prediction models relies on only a few techniques with inherent limitations and biases, reducing the accuracy and reproducibility. We developed a new droplet digital PCR assay format for accurate DNA methylation quantification, based on three LNA-containing hydrolysis probes to detect methylated and unmethylated alleles. Using a 12-plex assay we simultaneously quantified methylation at six CpGs ( ASPA , C1orf132 , CCDC102B , EDARADD , ELOVL2 , FHL2 ) in 351 blood samples (age range: 0–95 years), showing strong correlations with age (| r| > 0.83). Several age-prediction models were developed, achieving high performance on testing sets ( R 2 : 0.933–0.973, MAE: 3.18–5.18, RMSE: 4.71–7.27).
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- The 12 o’clock assay: an optimized dodecaplex droplet digital PCR assay for robust DNA methylation quantification and epigenetic clock-based age-predictions
- Date Crossref
- 24/03/2026
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Fondation Jean Dausset-CEPH pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Autorité de sûreté nucléaire et de radioprotection PSE-SANTE/SERAMED/LRAcc pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Inserm pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Institut Curie pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Conservatoire National des Arts et Métiers pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Génomique Bioinformatique et Applications pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Génomique pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Université Paris Cité Nutritional Epidemiology Research Team (EREN) pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institut National de Recherche pour l'Agriculture pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Université Sorbonne Paris Nord pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Sorbonne Paris Cité pays non établi dans la noticeInstitution
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Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Fondation Jean Dausset-CEPH, PSE-SANTE/SERAMED/LRAcc — Autorité de sûreté nucléaire et de radioprotection et Inserm, avec 9 autres affiliations.
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