Telomere-to-telomere assembly detects genomic diversity in Canadian strains of Borrelia burgdorferi
Rattachement africain : ca. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Borrelia burgdorferi, the bacteria causing Lyme disease, has a complex genome comprising a linear chromosome and multiple linear and circular plasmids. The atypical hairpin telomeres and the highly paralogous plasmids complicate genome assembly. We develop a genome assembly pipeline using both long and short reads to overcome these challenges. Using long reads, we assemble the hairpin telomeres of the linear replicons, an lp28-1a plasmid subtype, and circular plasmids of nine B. burgdorferi strains from five regions across Northwest Ontario and Manitoba, Canada. Although similar across the core conserved genomic regions, all strains carry a ∼2-10 kb right telomeric end identical to lp28-1, leading to variability in telomere length and gene content. Additionally, we observe diversity at the linear chromosome hairpin telomeric sequences, ospC types, and plasmid profiles, highlighting the genomic diversity among the geographically proximate strains and suggesting such variations as possible mechanisms of rapid evolution.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Telomere-to-telomere assembly detects genomic diversity in Canadian strains of Borrelia burgdorferi
- Date Crossref
- 01/02/2026
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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McGill Genome Centre pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Université de Montréal pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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McGill University Department of Microbiology and Immunology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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McGill University Health Centre pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Cegep de Saint Hyacinthe pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Faculty of Medicine and Health Sciences Department of Human Genetics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Faculté de Médecine Vétérinaire Département de Pathologie et Microbiologie pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Computer Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
McGill Genome Centre, Université de Montréal et Department of Microbiology and Immunology — McGill University, avec 5 autres affiliations.
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