Phylogeny‐Aware Metabologenomics Accurately Assigns Natural Products to Biosynthetic Gene Clusters
Rattachement africain : de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
ABSTRACT Tens of thousands of biosynthetic gene clusters (BGCs) have been identified in microbial genomes, but the vast majority of associated natural products (NPs) and their underlying biosyntheses remain unknown. Metabologenomics approaches integrate genomic and metabolomic datasets to statistically associate BGCs to their cognate NPs, yet often suggest many false links. Here, we show that incorporating information on the producer strains' phylogeny greatly improves accuracy. We sequenced 72 Sorangium spp. genomes (myxobacteria), predicting 2030 BGCs in 265 gene cluster families (GCFs). Mass spectrometry (MS 1 ) revealed 99 metabolite families (MFs) from the same strains. Using a phylogeny‐aware statistical analysis, we identified 43 high‐confidence associations between GCFs and MFs, correctly including 89% of previously characterised links and reducing spurious associations by 33‐fold, compared to simple correlational analysis. Our approach identified previously unknown BGCs for rowithocin and an undescribed poly‐glycosylated NP. It also identified a distinct BGC associated with the production of chlorotonil C variants and refined the BGC for maracen. This study demonstrates the effectiveness of phylogeny‐aware metabologenomics as a scalable strategy for NP discovery and biosynthetic pathway elucidation, and provides a roadmap to improved analyses of paired‐omics data towards NP discovery.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Phylogeny‐Aware Metabologenomics Accurately Assigns Natural Products to Biosynthetic Gene Clusters
- Date Crossref
- 01/01/2026
- Éditeur
- Wiley
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Leibniz Association pays non établi dans la noticeOrganisme public
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German Center for Infection Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Leibniz Institute DSMZ – German Collection of Microorganisms and Cell Cultures pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Helmholtz Institute for Pharmaceutical Research Saarland pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Saarland University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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European Molecular Biology Laboratory pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Helmholtz Centre for Infection Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Technische Universität Braunschweig pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Leibniz Institute DSMZ Microbial Genome Research Braunschweig Germany pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Leibniz Institute DSMZ Microbial Ecology and Diversity Research Braunschweig Germany pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Technical University of Braunschweig Institute of Microbiology Braunschweig Germany pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Leibniz Association, German Center for Infection Research et Leibniz Institute DSMZ – German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, avec 8 autres affiliations.
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