A Conserved 3′UTR Stem–loop Directs UPF1/eIF4AIII-Dependent Regulation of GABARAPL1 mRNA
Rattachement africain : fr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
RNA-binding proteins (RBP) interact with mRNA untranslated regions containing cis-regulatory elements to govern mRNA localization, stability, and translational efficiency. Among these trans-regulatory factors, RNA helicase UPF1 is a central factor which play a role in multiple mRNA decay pathways, including nonsense-mediated mRNA decay (NMD). NMD is triggered when an exon-junction complex (EJC) is located downstream of a premature termination codon. However, in some cases, NMD can be activated in an EJC-independent manner through mechanisms involving the 3'UTR. In the present study, we focused on the GABARAPL1 3'UTR, as previous studies had shown that this region plays a key role in NMD targeting, although the underlying molecular mechanism had not yet been elucidated. Unlike canonical NMD targets such as SC35, we found that the chemical inhibition of eIF4AIII helicase activity did not affect GABARAPL1 transcript levels, indicating that this transcript is regulated through its 3'UTR via an EJC-independent mechanism. We therefore investigated the potential presence of cis-regulatory element within the 3'UTR of GABARAPL1 which can regulate mRNA and protein levels in a UPF1-dependent manner. Furthermore, we identified a conserved RNA region spanning nucleotides 364-421 involved in GABARAPL1 targeting and used biochemical analysis to demonstrate the direct binding of UPF1 and eIF4AIII to this RNA region, to analyse its secondary structure in solution, and to map the protein-binding sites. By complementing these approaches with molecular modelling, we showed that this stem-loop adopts a stable global fold but a local flexibility and dynamic behaviour properties. Together, our results support the role of UPF1 and eIF4AIII as specific regulators of GABARAPL1 transcript and reveal a novel RNA regulatory element within its 3'UTR, which provides a completely unexpected binding site for these factors.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- A Conserved 3′UTR Stem–loop Directs UPF1/eIF4AIII-Dependent Regulation of GABARAPL1 mRNA
- Date Crossref
- 01/10/2026
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Inserm pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Interactions Hôte-Greffon-Tumeur & Ingénierie Cellulaire et Génique pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Université de Franche-Comté pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Lyon 1 Université pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Institut Pasteur pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Architecture et Réactivité de l'arN pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Université Marie et Louis Pasteur pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université Lyon UMR5086 CNRS pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université de Strasbourg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Inserm, Interactions Hôte-Greffon-Tumeur & Ingénierie Cellulaire et Génique et Université de Franche-Comté, avec 8 autres affiliations.
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