Specification curve analysis of the TEDDY study reveals large variation in microbiome-based T1D predictive performance
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The microbiome may play a role in predicting future Type 1 Diabetes (T1D) risk. Associations between the microbiome and T1D onset are well documented but observational microbiome studies are difficult to interpret and reproduce due to differences in study designs. To evaluate if the microbiome is a robust predictor of T1D or T1D associated autoantibodies, we performed a “specification curve analysis” from a longitudinal cohort of 783 individuals at high risk of T1D, that attempts to parameterize and systematically test all possible study design specifications. We predicted T1D and autoantibodies using 11,189 different specifications. We show a large amount of variation in the predictive ability of the microbiome across specifications. 72.5% of models that only use microbial features had an area under the curve (AUC) of 0.5 and the “best” model had an AUC of 0.78. Results for every specification can also be found in an interactive app at: http://apps.chiragjpgroup.org/teddy . In this study, the authors systematically tested how seemingly small changes in a computational analysis can lead to significant variations in results, and show that regardless of all such choices, the microbiome poorly predicts Type 1 Diabetes risk.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Specification curve analysis of the TEDDY study reveals large variation in microbiome-based T1D predictive performance
- Date Crossref
- 28/10/2025
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Joslin Diabetes Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Harvard University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Cornell University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Michigan pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Department of Microbiology pays non établi dans la noticeInstitution
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Section on Islet Cell and Regenerative Biology pays non établi dans la noticeInstitution
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Section on Pathophysiology and Molecular Pharmacology pays non établi dans la noticeInstitution
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Department of Biomedical Informatics pays non établi dans la noticeInstitution
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Weill Cornell Medical College Department of Physiology and Biophysics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Public Health Department of Environmental Health Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Joslin Diabetes Center, Harvard University et Cornell University, avec 7 autres affiliations.
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