Native Massenspektrometrie erleichtert die Hit‐Validierung in der DNA‐Encoded Library Technologie

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Zusammenfassung Die DNA‐encoded Library (DEL) Technologie hat sich als zentrales Instrument der Wirkstoffentwicklung etabliert und wird sowohl in der Industrie als auch in der akademischen Forschung breit eingesetzt. Eine zunehmende Anzahl von durch DEL entwickelten Wirkstoffen befindet sich in der klinischen Entwicklung. Obwohl durch affinitätsbasierte Selektionen Milliarden von Verbindungen gleichzeitig gescreent werden können, stellt die Validierung und Charakterisierung einzelner Hits aus DEL‐Selektionen nach wie vor einen erheblichen Engpass dar, da diese aufwendig und zeitintensiv sein kann. In dieser Arbeit beschreiben wir den Einsatz von nativer Massenspektrometrie zur schnellen Hit‐Validierung von On‐DNA‐Verbindungen. Durch den Erhalt nicht‐kovalenter Wechselwirkungen in der Gasphase können Komplexe aus Proteinen und ihren jeweiligen On‐DNA‐Liganden ohne zusätzliche Markierung oder Immobilisierung analysiert werden. Mithilfe des hier beschriebenen Workflows konnten wir die Affinitäten verschiedener aufgereinigter On‐DNA‐Binder zuverlässig einstufen oder die Bindung von On‐DNA‐Verbindungen aus unaufgereinigten Synthesegemischen nachweisen, wodurch der Bedarf an aufwendigen Reinigungsverfahren verringert wird. Darüber hinaus bietet die hier vorgestellte Methodik wertvolle Einblicke, welche Substruktur eines Bindemoleküls am stärksten zur Bindung beiträgt, und erleichtert somit die anschließenden medizinal‐chemischen Optimierungen.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.