A simple, fast and cost-efficient protocol for ultra-sensitive ribosome profiling
Rattachement africain : de, il. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract Ribosome profiling has become an essential tool for studying mRNA translation in cells with codon-level resolution. However, its widespread application remains hindered by the labour-intensive workflow, low efficiency and high costs associated with sequencing sample preparation. Here, we present a new cost-effective and ultra-sensitive library preparation method that significantly advances the applicability of ribosome profiling. By implementing bead-coupled enzymatic reactions and product purifications, our approach increases both yield and throughput while maintaining high reproducibility. Demonstrating the sensitivity of the protocol we prepared libraries from as little as 12 fmol of RNA, which expands the feasibility of ribosome profiling from minimal input samples, such as derived from small populations, stressed cells, or patient-derived specimens. Additionally, we validate the versatility of the protocol across multiple species and demonstrate its applicability for RNA-seq library preparation. Altogether, this protocol provides a highly accessible and efficient alternative to existing ribosome profiling workflows, facilitating research in previously challenging experimental contexts.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- A simple, fast and cost-efficient protocol for ultra-sensitive ribosome profiling
- Date Crossref
- 15/04/2025
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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German Cancer Research Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Heidelberg University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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DKFZ-ZMBH Alliance pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Ben-Gurion University of the Negev Ilse Katz Institute for Nanoscale Science and Technology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hebrew University of Jerusalem pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Faculty of Medicine Department of Microbiology and Molecular Genetics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
German Cancer Research Center, Heidelberg University et DKFZ-ZMBH Alliance, avec 3 autres affiliations.
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