Nanopore-based hybridization capture approaches for targeted viral metagenomics and whole-genome sequencing
Rattachement africain : ca, gb. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract Hybridization capture approaches can significantly increase the sensitivity of metagenomics. However, their implementation with Oxford Nanopore Technologies (ONT) sequencing has been limited due to the lack of dedicated workflows and the need for an extra ligation-based library preparation step. We developed a universal four-primer PCR approach that allows the implementation of hybridization capture workflows with ONT without additional ligation-based steps. Our method allowed the fast conversion of a targeted metagenomics workflow, increasing ONT sensitivity by 10 to 100-fold compared to untargeted approaches and providing both rapid detection and whole-genome sequences where the pathogen was abundant and identification where viral loads were low.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Nanopore-based hybridization capture approaches for targeted viral metagenomics and whole-genome sequencing
- Date Crossref
- 09/04/2025
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Institute of Infection and Immunity pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University College London Great Ormond Street Institute of Child Health pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Great Ormond Street Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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University of Oxford Nuffield Department of Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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NHS Blood and Transplant pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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The George Institute for Global Health pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Great Ormond Street Hospital for Children NHS Foundation Trust pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Faculty of Medicine and Health Sydney Infectious Diseases Institute pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Institute of Infection and Immunity, Great Ormond Street Institute of Child Health — University College London et Great Ormond Street Hospital, avec 5 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.