Proteogenomic characterization of non-functional pancreatic neuroendocrine tumors unravels clinically relevant subgroups
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Le résumé fourni par la source
The majority of neuroendocrine neoplasms in pancreas are non-functional pancreatic neuroendocrine tumors (NF-PanNETs), which exhibit a high occurrence of distant metastases with limited therapeutic options. Here, we perform a comprehensive molecular characterization of 108 NF-PanNETs through integrative analysis of genomic, transcriptomic, proteomic, and phosphoproteomic profiles. Proteogenomic analysis provides functional insights into the genomic driver alterations of NF-PanNETs, revealing a potential mediator of MEN1 alterations using Men1-conditional knockout mice. Machine-learning-based modeling uncovers a three-protein signature as an independent prognostic factor, which is validated by an independent external cohort. Proteomic and phosphoproteomic-based stratification identifies four subtypes with distinct molecular characteristics, immune microenvironments, and clinicopathological features. Drug screening using patient-derived tumor organoids identifies cyclin-dependent kinase (CDK) 5 and Calcium Voltage-Gated Channel Subunit Alpha1 D (CACNA1D) as ubiquitous and subtype-specific targets, respectively, with in vivo validation using xenograft models. Together, our proteogenomic analyses illustrate a comprehensive molecular landscape of NF-PanNETs, revealing biological insights and therapeutic vulnerabilities.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Proteogenomic characterization of non-functional pancreatic neuroendocrine tumors unravels clinically relevant subgroups
- Date Crossref
- 01/04/2025
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Fudan University Shanghai Cancer Center Department of Pancreatic Surgery pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Peking University State Key Laboratory of Holistic Integrative Management of Gastrointestinal Cancers pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Peking University Cancer Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Chinese Academy of Sciences Department of Analytical Chemistry pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Shanghai Institute of Materia Medica pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Center for Excellence in Molecular Cell Science pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Second Military Medical University Department of Hepatobiliary Pancreatic Surgery pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Changhai Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Icahn School of Medicine at Mount Sinai Department of Genetics and Genomic Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Baylor College of Medicine Lester and Sue Smith Breast Center pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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James S. McDonnell Foundation pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Cancer Clinic pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
Department of Pancreatic Surgery — Fudan University Shanghai Cancer Center, State Key Laboratory of Holistic Integrative Management of Gastrointestinal Cancers — Peking University et Peking University Cancer Hospital, avec 9 autres affiliations.
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