KMT2C/KMT2D-dependent H3K4me1 mediates changes in DNA replication timing and origin activity during a cell fate transition
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Mammalian genomes replicate in a cell-type-specific order during the S phase, correlated to transcriptional activity, histone modifications, and chromatin structure. The causal relationships between these features and DNA replication timing (RT), especially during cell fate changes, are largely unknown. Using machine learning, we quantify 21 chromatin features predicting local RT and RT changes during differentiation in embryonic stem cells (ESCs). About one-third of the genome shows RT changes during differentiation. Chromatin features accurately predict both steady-state RT and RT changes. Histone H3 lysine 4 monomethylation (H3K4me1), catalyzed by KMT2C and KMT2D (KMT2C/D), emerges as a top predictor. Loss of KMT2C/D or their enzymatic activities impairs RT changes during differentiation. This correlates with local H3K4me1 loss and reduced replication origin firing, while transcription remains largely unaffected. Our findings reveal KMT2C/D-dependent H3K4me1 as a key regulator of RT and replication initiation, a role that likely impacts diseases associated with KMT2C/D mutations.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- KMT2C/KMT2D-dependent H3K4me1 mediates changes in DNA replication timing and origin activity during a cell fate transition
- Date Crossref
- 01/02/2025
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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University of California Center for Reproductive Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Broad Center pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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UCSF Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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New York University Department of Biochemistry & Molecular Pharmacology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Center for Reproductive Sciences — University of California, Broad Center et UCSF Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, avec 1 autre affiliation.
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