Expanding the concept of ID conversion in TogoID by introducing multi-semantic and label features
Rattachement africain : jp. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
BACKGROUND: TogoID ( https://togoid.dbcls.jp/ ) is an identifier (ID) conversion service designed to link IDs across diverse categories of life science databases. With its ability to obtain IDs related in different semantic relationships, a user-friendly web interface, and a regular automatic data update system, TogoID has been a valuable tool for bioinformatics. RESULTS: We have recently expanded TogoID's ability to represent semantics between datasets, enabling it to handle multiple semantic relationships within dataset pairs. This enhancement enables TogoID to distinguish relationships such as "glycans bind to proteins" or "glycans are processed by proteins" between glycans and proteins. Additional new features include the ability to display labels corresponding to database IDs, making it easier to interpret the relationships between the various IDs available in TogoID, and the ability to convert labels to IDs, extending the entry point for ID conversion. The implementation of URL parameters, which reproduces the state of TogoID's web application, allows users to share complex search results through a simple URL. CONCLUSIONS: These advancements improve TogoID's utility in bioinformatics, allowing researchers to explore complex ID relationships. By introducing the tool's multi-semantic and label features, TogoID expands the concept of ID conversion and supports more comprehensive and efficient data integration across life science databases.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Expanding the concept of ID conversion in TogoID by introducing multi-semantic and label features
- Date Crossref
- 08/01/2025
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Research Organization of Information and Systems pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Database Center for Life Science pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Soka University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Chiba University Institute for Advanced Academic Research pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Graduate School of Science and Engineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Graduate School of Medicine Department of Artificial Intelligence Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Research Organization of Information and Systems, Database Center for Life Science et Soka University, avec 3 autres affiliations.
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