Mapping extrachromosomal DNA amplifications during cancer progression
Rattachement africain : kr, us, lu, nl. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
To understand the role of extrachromosomal DNA (ecDNA) amplifications in cancer progression, we detected and classified focal amplifications in 8,060 newly diagnosed primary cancers, untreated metastases and heavily pretreated tumors. The ecDNAs were detected at significantly higher frequency in untreated metastatic and pretreated tumors compared to newly diagnosed cancers. Tumors from chemotherapy-pretreated patients showed significantly higher ecDNA frequency compared to untreated cancers. In particular, tubulin inhibition associated with ecDNA increases, suggesting a role for ecDNA in treatment response. In longitudinally matched tumor samples, ecDNAs were more likely to be retained compared to chromosomal amplifications. EcDNAs shared between time points, and ecDNAs in advanced cancers were more likely to harbor localized hypermutation events compared to private ecDNAs and ecDNAs in newly diagnosed tumors. Relatively high variant allele fractions of ecDNA localized hypermutations implicated early ecDNA mutagenesis. Our findings nominate ecDNAs to provide tumors with competitive advantages during cancer progression and metastasis.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Mapping extrachromosomal DNA amplifications during cancer progression
- Date Crossref
- 14/10/2024
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Sungkyunkwan University Epigenome Dynamics Control Research Center pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Yale University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Jackson Laboratory pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
The Jackson Laboratory for Genomic Medicine pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
Luxembourg Institute of Health pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
University of California San Diego pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
University of Luxembourg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Luxembourg Institute of Science and Technology pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
Seoul National University Hospital Advanced Institutes of Convergence Technology pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
Advanced Institute of Convergence Technology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Amsterdam University Medical Centers Department of Neurosurgery pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
School of Pharmacy Department of Biohealth Regulatory Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Epigenome Dynamics Control Research Center — Sungkyunkwan University, Yale University et Jackson Laboratory, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.