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Accès ouvert déclaré 2024 preprint

A multi-omics and cell type-specific characterization of the ventral striatum in human cocaine use disorder

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2Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : ca, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Abstract Epigenome, transcriptome, and proteome analyses of postmortem brains have revealed initial molecular insights into cocaine use disorder (CUD). However, the inter-relationship between these –omics and the contribution of individual cell types remain largely unknown. We present an in-depth analysis of molecular changes in the ventral striatum in CUD at multi-omics and single-cell resolution. Integrative multi-omics analyses of microRNA-seq, RNA-seq, and proteomics datasets in 41 individuals and single-nuclei RNA-seq in a subset of 16 individuals revealed conserved deregulation of metabolic pathways, oxidative phosphorylation, and glutamatergic signaling. Cell type-specific analyses identified inverse metabolic pathway deregulation patterns in glial and neuronal cells, notably in astrocytes and medium spiny neurons (MSNs). Characterizing astrocyte-neuron crosstalk revealed altered glutamatergic and cell adhesion signaling in CUD. By applying a comprehensive multi-omics analytical framework, our study provides novel insights into CUD-associated molecular changes in the ventral striatum, suggesting astrocytes, MSNs, and their crosstalk as particularly perturbed in CUD.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
A multi-omics and cell type-specific characterization of the ventral striatum in human cocaine use disorder
Date Crossref
12/10/2024
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • McGill University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University of Bonn pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Central Institute of Mental Health pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • Heidelberg University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University Hospital Heidelberg pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • University Medical Centre Mannheim pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • CIMH Mannheim pays non établi dans la notice
    Institution
  • Hector Institute for Translational Brain Research CIMH Mannheim pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • European Molecular Biology Laboratory pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Institute of Psychopharmacology CIMH Mannheim pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • University Hospital Mannheim pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure

McGill University, University of Bonn et Central Institute of Mental Health, avec 8 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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