Master Regulators of Causal Networks in Intestinal- and Diffuse-Type Gastric Cancer and the Relation to the RNA Virus Infection Pathway
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Le résumé fourni par la source
Causal networks are important for understanding disease signaling alterations. To reveal the network pathways affected in the epithelial-mesenchymal transition (EMT) and cancer stem cells (CSCs), which are related to the poor prognosis of cancer, the molecular networks and gene expression in diffuse- and intestinal-type gastric cancer (GC) were analyzed. The network pathways in GC were analyzed using Ingenuity Pathway Analysis (IPA). The analysis of the probe sets in which the gene expression had significant differences between diffuse- and intestinal-type GC in RNA sequencing of the publicly available data identified 1099 causal networks in diffuse- and intestinal-type GC. Master regulators of the causal networks included lenvatinib, pyrotinib, histone deacetylase 1 (HDAC1), mir-196, and erb-b2 receptor tyrosine kinase 2 (ERBB2). The analysis of the HDAC1-interacting network identified the involvement of EMT regulation via the growth factors pathway, the coronavirus pathogenesis pathway, and vorinostat. The network had RNA-RNA interactions with microRNAs such as mir-10, mir-15, mir-17, mir-19, mir-21, mir-223, mir-25, mir-27, mir-29, and mir-34. The molecular networks revealed in the study may lead to identifying drug targets for GC.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Master Regulators of Causal Networks in Intestinal- and Diffuse-Type Gastric Cancer and the Relation to the RNA Virus Infection Pathway
- Date Crossref
- 13/08/2024
- Éditeur
- MDPI AG
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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National Institute of Health Sciences Center for Biological Safety and Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Innovation Center of NanoMedicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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The University of Tokyo pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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U.S. Army Engineer Research and Development Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Kobe University Department of Pathology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Kawasaki Institute of Industrial Promotion Innovation Centre of NanoMedicine (iCONM) pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Graduate School of Engineering Department of Bioengineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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US Army Engineer Research and Development Center pays non établi dans la noticeInstitution
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National Cancer Center Research Institute Department of Pharmacology and Therapeutics pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Center for Biological Safety and Research — National Institute of Health Sciences, Innovation Center of NanoMedicine et The University of Tokyo, avec 6 autres affiliations.
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