Neoantigen landscape supports feasibility of personalized cancer vaccine for follicular lymphoma
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Le résumé fourni par la source
ABSTRACT: Personalized cancer vaccines designed to target neoantigens represent a promising new treatment paradigm in oncology. In contrast to classical idiotype vaccines, we hypothesized that "polyvalent" vaccines could be engineered for the personalized treatment of follicular lymphoma (FL) using neoantigen discovery by combined whole-exome sequencing (WES) and RNA sequencing (RNA-seq). Fifty-eight tumor samples from 57 patients with FL underwent WES and RNA-seq. Somatic and B-cell clonotype neoantigens were predicted and filtered to identify high-quality neoantigens. B-cell clonality was determined by the alignment of B-cell receptor (BCR) CDR3 regions from RNA-seq data, grouping at the protein level, and comparison with the BCR repertoire from healthy individuals using RNA-seq data. An average of 52 somatic mutations per patient (range, 2-172) were identified, and ≥2 (median, 15) high-quality neoantigens were predicted for 56 of 58 FL samples. The predicted neoantigen peptides were composed of missense mutations (77%), indels (9%), gene fusions (3%), and BCR sequences (11%). Building off of these preclinical analyses, we initiated a pilot clinical trial using personalized neoantigen vaccination combined with PD-1 blockade in patients with relapsed or refractory FL (#NCT03121677). Synthetic long peptide vaccines targeting predicted high-quality neoantigens were successfully synthesized for and administered to all 4 patients enrolled. Initial results demonstrate feasibility, safety, and potential immunologic and clinical responses. Our study suggests that a genomics-driven personalized cancer vaccine strategy is feasible for patients with FL, and this may overcome prior challenges in the field. This trial was registered at www.ClinicalTrials.gov as #NCT03121677.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Neoantigen landscape supports feasibility of personalized cancer vaccine for follicular lymphoma
- Date Crossref
- 29/07/2024
- Éditeur
- American Society of Hematology
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Washington University in St. Louis pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Addgene pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Repligen (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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James S. McDonnell Foundation pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Washington University School of Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Waltham pays non établi dans la noticeInstitution
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BostonGene pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Washington University in St Louis pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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McDonnell Genome Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Washington Universoty School of Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Washington University in St. Louis, Addgene et Repligen (United States), avec 7 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.