Reviewer #2 (Public Review): Transcriptional immune suppression and upregulation of double stranded DNA damage and repair repertoires in ecDNA-containing tumors
Rattachement africain : kr, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Extrachromosomal DNA is a common cause of oncogene amplification in cancer. The non-chromosomal inheritance of ecDNA enables tumors to rapidly evolve, contributing to treatment resistance and poor outcome for patients. The transcriptional context in which ecDNAs arise and progress, including chromosomally-driven transcription, is incompletely understood. We examined gene expression patterns of 870 tumors of varied histological types, to identify transcriptional correlates of ecDNA. Here we show that ecDNA containing tumors impact four major biological processes. Specifically, ecDNA containing tumors upregulate DNA damage and repair, cell cycle control, and mitotic processes, but downregulate global immune regulation pathways. Taken together, these results suggest profound alterations in gene regulation in ecDNA containing tumors, shedding light on molecular processes that give rise to their development and progression.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Reviewer #2 (Public Review): Transcriptional immune suppression and upregulation of double stranded DNA damage and repair repertoires in ecDNA-containing tumors
- Date Crossref
- 27/02/2024
- Éditeur
- eLife Sciences Publications, Ltd
- Type
- peer-review
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Où se fait cette recherche
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Korea Institute of Brain Science pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of California San Diego pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Department of Biomedical Systems Informatics and Brain Korea pays non établi dans la noticeInstitution
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University of California at San Diego Bioinformatics and Systems Biology Graduate Program pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Korea Institute of Brain Science, University of California San Diego et Department of Biomedical Systems Informatics and Brain Korea, avec 1 autre affiliation.
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