Identification of a lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA network in Nasopharyngeal Carcinoma by deep sequencing and bioinformatics analysis
Rattachement africain : cn, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Background: Accumulating evidence indicates that non-coding RNAs (ncRNA), including long non-coding RNAs (lncRNAs) and circular RNAs (circRNAs), can function as competitive endogenous RNAs (ceRNAs) by binding to microRNAs (miRNAs) and regulating host gene expression at the transcriptional or post-transcriptional level.Dysregulation in ceRNA network regulation has been implicated in the occurrence and development of cancer.However, the lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA regulatory network is still lacking in nasopharyngeal carcinoma (NPC).Methods: Differentially expressed genes (DEGs) were obtained from our previous sequencing data and Gene Expression Omnibus (GEO).Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway (KEGG) were used to explore the biological functions of these common DEGs.Through a series of bioinformatic analyses, the lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA network was established.In additional, the external data GSE102349 was used to test the prognostic value of the hub mRNAs through the Kaplan-Meier method.Results: We successfully constructed a lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA network in NPC, consisting of 16 lncRNAs, 6 miRNAs, 3 circRNAs and 10 mRNAs and found that three genes (TOP2A, ZWINT, TTK) were significantly associated with overall survival time (OS) in patients.Conclusion: The regulatory network revealed in this study may help comprehensively elucidate the ceRNA mechanisms driving NPC, and provide novel candidate biomarkers for evaluating the prognosis of NPC.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Identification of a lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA network in Nasopharyngeal Carcinoma by deep sequencing and bioinformatics analysis
- Date Crossref
- 01/01/2024
- Éditeur
- Ivyspring International Publisher
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Central South University NHC Key Laboratory of Cancer Proteomics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hunan Cancer Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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National Clinical Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Xiangya Hospital Central South University pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Changsha Medical University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Second Xiangya Hospital of Central South University pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Changsha Medical College Department of Pathology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
NHC Key Laboratory of Cancer Proteomics — Central South University, Hunan Cancer Hospital et National Clinical Research, avec 4 autres affiliations.
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