Chromosome-level genome assembly of the common chiton, Liolophura japonica (Lischke, 1873)
Rattachement africain : hk, gb, us, it. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract Chitons (Polyplacophora) are marine molluscs that can be found worldwide from cold waters to the tropics, and play important ecological roles in the environment. Nevertheless, there remains only two chiton genomes sequenced to date. The chiton Liolophura japonica (Lischke, 1873) is one of the most abundant polyplacophorans found throughout East Asia. Our PacBio HiFi reads and Omni-C sequencing data resulted in a high-quality near chromosome-level genome assembly of ∼609 Mb with a scaffold N50 length of 37.34 Mb (96.1% BUSCO). A total of 28,233 genes were predicted, including 28,010 protein-coding genes. The repeat content (27.89%) was similar to the other Chitonidae species and approximately three times lower than in the genome of the Hanleyidae chiton. The genomic resources provided in this work will help to expand our understanding of the evolution of molluscs and the ecological adaptation of chitons.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.
- Titre Crossref
- Chromosome-level genome assembly of the common chiton, <i>Liolophura japonica</i> (Lischke, 1873)
- Date Crossref
- 17/01/2024
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Chinese University of Hong Kong Department of Computer Science and Engineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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City University of Hong Kong State Key Laboratory of Marine Pollution and Department of Biomedical Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Education University of Hong Kong Department of Science and Environmental Studies pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hong Kong Polytechnic University State Key Laboratory of Marine Pollution pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Hong Kong pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hong Kong University of Science and Technology Department of Ocean Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Suffolk pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hong Kong Baptist University Croucher Institute for Environmental Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Discovery Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Istituto di Scienze Marine del Consiglio Nazionale delle Ricerche pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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School of Life Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Department of Computer Science and Engineering — Chinese University of Hong Kong, State Key Laboratory of Marine Pollution and Department of Biomedical Sciences — City University of Hong Kong et Department of Science and Environmental Studies — Education University of Hong Kong, avec 9 autres affiliations.
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