Aller au contenu principal
Accès ouvert déclaré 2024 preprint

Chromosomal-level genome assembly of golden birdwing Troides aeacus (Felder & Felder, 1860)

0Citations signalées, ce qui n’est pas une note de qualité
12Institutions déclarées
4Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : hk, ca, gb, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Abstract Troides aeacus , the golden birdwing (Lepidoptera, Papilionidae) is a large swallowtail butterfly widely distributed in Asia. Despite its occurrence, T. aeacus has been assigned as a major protective species in many places given the loss of their native habitats under urbanisation and anthropogenic activities. Nevertheless, the lack of its genomic resources hinders our understanding of their biology, diversity, as well as carrying out conservation measures based on genetic information or markers. Here, we report the first chromosomal-level genome assembly of T. aeacus using a combination of PacBio SMRT and Omni-C scaffolding technologies. The assembled genome (351 Mb) contains 98.94% of the sequences anchored to 30 pseudo-molecules. The genome assembly also has high sequence continuity with scaffold length N50 = 12.2 Mb. A total of 28,749 protein-coding genes were predicted, and high BUSCO score completeness (98.9% of BUSCO metazoa_odb10 genes) was also revealed. This high-quality genome offers a new and significant resource for understanding the swallowtail butterfly biology, as well as carrying out conservation measures of this ecologically important lepidopteran species.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.

Titre Crossref
Chromosomal-level genome assembly of golden birdwing <i>Troides aeacus</i> (Felder &amp; Felder, 1860)
Date Crossref
15/01/2024
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • Chinese University of Hong Kong pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • City University of Hong Kong State Key Laboratory of Marine Pollution and Department of Biomedical Sciences pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Education University of Hong Kong Department of Science and Environmental Studies pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Health PEI pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • Hong Kong Polytechnic University Department of Food Science and Nutrition pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University of Hong Kong pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Hong Kong University of Science and Technology Department of Ocean Science pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University of Suffolk pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Lingnan University Science Unit pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Hong Kong Baptist University Croucher Institute for Environmental Sciences pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute pays non établi dans la notice
    Organisation à but non lucratif
  • Discovery Institute pays non établi dans la notice
    Organisation à but non lucratif

Chinese University of Hong Kong, State Key Laboratory of Marine Pollution and Department of Biomedical Sciences — City University of Hong Kong et Department of Science and Environmental Studies — Education University of Hong Kong, avec 9 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

Lepidoptera: Biology and TaxonomyGenomics and Phylogenetic StudiesGenetic diversity and population structure

BNTIC News n’est pas le producteur de ces données. Les publications sont interrogées à la demande dans Crossref, OpenAIRE, DOAJ, Europe PMC, HAL, DataCite, AfricArXiv, ROR et la Banque mondiale, sans clé d’accès. OpenAlex reste optionnel. Aucun service payant n’est nécessaire et aucune donnée externe n’est enregistrée en base. Consulter les sources et leurs limites.