Genome assembly of the milky mangrove Excoecaria agallocha
Rattachement africain : hk, ca, gb, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract The milky mangrove Excoecaria agallocha is a latex-secreting mangrove that are distributed in tropical and subtropical regions. While its poisonous latex is regarded as a potential source of phytochemicals for biomedical applications, the genomic resources of E. agallocha remains limited. Here, we present a chromosomal level genome of E. agallocha , assembled from the combination of PacBio long-read sequencing and Omni-C data. The resulting assembly size is 1,332.45 Mb and has high contiguity and completeness with a scaffold N50 of 58.9 Mb and a BUSCO score of 98.4 %. 73,740 protein-coding genes were also predicted. The milky mangrove genome provides a useful resource for further understanding the biosynthesis of phytochemical compounds in E. agallocha .
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.
- Titre Crossref
- Genome assembly of the milky mangrove <i>Excoecaria agallocha</i>
- Date Crossref
- 15/01/2024
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Chinese University of Hong Kong pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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City University of Hong Kong State Key Laboratory of Marine Pollution and Department of Biomedical Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Education University of Hong Kong Department of Science and Environmental Studies pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Health PEI pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Hong Kong Polytechnic University Department of Food Science and Nutrition pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Hong Kong pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hong Kong University of Science and Technology Department of Ocean Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Suffolk pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Lingnan University Science Unit pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hong Kong Baptist University Croucher Institute for Environmental Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Discovery Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
Chinese University of Hong Kong, State Key Laboratory of Marine Pollution and Department of Biomedical Sciences — City University of Hong Kong et Department of Science and Environmental Studies — Education University of Hong Kong, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.