SNP discovery by exome capture and resequencing in a pea genetic resource collection
Rattachement africain : fr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Pea is a major pulse crop in temperate regions and a model plant in genetics. Large genetic marker resources are needed to assess the genetic diversity in the species genepool and to provide selection tools for breeders. In this study, we used second-generation sequencing to perform an exome-capture protocol using a diverse pea germplasm collection, and produced a resource of over 2 million Single Nucleotide Polymorphisms. This dataset was then used to characterize the genetic diversity present in the panel and compute phylogenetic and structure analyses. The development of this resource paves the way for Genome-wide association studies and the development of powerful genotyping tools.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- SNP discovery by exome capture and resequencing in a pea genetic resource collection
- Date Crossref
- 13/10/2023
- Éditeur
- Peer Community In
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Institut National de Recherche pour l'Agriculture pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Agroécologie pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institut Agro Dijon INRAE pays non établi dans la noticeInstitution
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Limagrain (France) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Commissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Université Paris-Saclay Institut François Jacob pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Genoscope pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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CEA Paris-Saclay pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Université de Lille pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université de Picardie Jules Verne pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institut de Génétique pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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L'Institut Agro pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Institut National de Recherche pour l'Agriculture, Agroécologie et INRAE — Institut Agro Dijon, avec 9 autres affiliations.
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