PathTracer Comprehensively Identifies Hypoxia-Induced Dormancy Adaptations in Mycobacterium tuberculosis
Rattachement africain : in. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Mining large-scale data to discover biologically relevant information remains a challenge despite the rapid development of bioinformatics tools. Here, we have developed a new tool, PathTracer, to identify biologically relevant information flows by mining genome-wide protein–protein interaction networks following integration of gene expression data. PathTracer successfully mines interactions between genes and traces the most perturbed paths of perceived activities under the conditions of the study. We further demonstrated the utility of this tool by identifying adaptation mechanisms of hypoxia-induced dormancy in Mycobacterium tuberculosis (Mtb).
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- PathTracer Comprehensively Identifies Hypoxia-Induced Dormancy Adaptations in<i>Mycobacterium tuberculosis</i>
- Date Crossref
- 27/09/2023
- Éditeur
- American Chemical Society (ACS)
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Indian Institute of Science Bangalore Department of Biochemistry pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Department of Biochemistry — Indian Institute of Science Bangalore.
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