Use of high-plex data provides novel insights into the temporal artery processes of giant cell arteritis
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Le résumé fourni par la source
Objective: spatial profiling of molecules involved in the temporal arteries of GCA patients and controls. Furthermore, we performed pharmacogenomic network analysis to identify potential treatment targets. Methods: Using human formalin-fixed paraffin-embedded temporal artery biopsy samples (GCA, n = 9; controls, n = 7), we performed a whole transcriptome analysis using the NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler. In total, 59 regions of interest were selected in the intima, media, adventitia, and perivascular adipose tissue (PVAT). Differentially expressed genes (DEGs) (fold-change > 2 or < -2, p-adjusted < 0.01) were compared across each layer to build a spatial and pharmacogenomic network and to explore the pathophysiological mechanisms of GCA. Results: Most of the transcriptome (12,076 genes) was upregulated in GCA arteries, compared to control arteries. Among the screened genes, 282, 227, 40, and 5 DEGs were identified in the intima, media, adventitia, and PVAT, respectively. Genes involved in the immune process and vascular remodeling were upregulated within GCA temporal arteries but differed across the arterial layers. The immune-related functions and vascular remodeling were limited to the intima and media. Conclusion: spatial profiling characterization of the molecules involved in GCA. The pharmacogenomic network analysis identified potential target genes for approved and novel immunotherapies.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Use of high-plex data provides novel insights into the temporal artery processes of giant cell arteritis
- Date Crossref
- 06/09/2023
- Éditeur
- Frontiers Media SA
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Inserm pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Mayo Clinic in Arizona Division of Rheumatology pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Hôpital Dupuytren pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Université de Limoges pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Salk Institute for Biological Studies Next Generation Sequencing Core pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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University of California San Diego Stem Cell Program pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université de Montpellier pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université de Nîmes pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Mayo Clinic pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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WinnMed pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Dupuytren University Hospital Division of Internal Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Faculty of Medicine INSERM U1308 pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Inserm, Division of Rheumatology — Mayo Clinic in Arizona et Hôpital Dupuytren, avec 9 autres affiliations.
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