An integrated organoid omics map extends modeling potential of kidney disease
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Le résumé fourni par la source
Kidney organoids are a promising model to study kidney disease, but their use is constrained by limited knowledge of their functional protein expression profile. Here, we define the organoid proteome and transcriptome trajectories over culture duration and upon exposure to TNFα, a cytokine stressor. Older organoids increase deposition of extracellular matrix but decrease expression of glomerular proteins. Single cell transcriptome integration reveals that most proteome changes localize to podocytes, tubular and stromal cells. TNFα treatment of organoids results in 322 differentially expressed proteins, including cytokines and complement components. Transcript expression of these 322 proteins is significantly higher in individuals with poorer clinical outcomes in proteinuric kidney disease. Key TNFα-associated protein (C3 and VCAM1) expression is increased in both human tubular and organoid kidney cell populations, highlighting the potential for organoids to advance biomarker development. By integrating kidney organoid omic layers, incorporating a disease-relevant cytokine stressor and comparing with human data, we provide crucial evidence for the functional relevance of the kidney organoid model to human kidney disease.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- An integrated organoid omics map extends modeling potential of kidney disease
- Date Crossref
- 14/08/2023
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Universität Hamburg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University Medical Center Hamburg-Eppendorf Hamburg Center for Kidney Health (HCKH) pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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University of Michigan Department of Internal Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Aarhus University Department of Biomedicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Aarhus University Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Michigan Medicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Aarhus Institute of Advanced Studies pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Universität Hamburg, Hamburg Center for Kidney Health (HCKH) — University Medical Center Hamburg-Eppendorf et Department of Internal Medicine — University of Michigan, avec 4 autres affiliations.
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