Transcriptional immune suppression and up-regulation of double-stranded DNA damage and repair repertoires in ecDNA-containing tumors
Rattachement africain : us, kr, gb. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Extrachromosomal DNA is a common cause of oncogene amplification in cancer. The non-chromosomal inheritance of ecDNA enables tumors to rapidly evolve, contributing to treatment resistance and poor outcome for patients. The transcriptional context in which ecDNAs arise and progress, including chromosomally-driven transcription, is incompletely understood. We examined gene expression patterns of 870 tumors of varied histological types, to identify transcriptional correlates of ecDNA. Here, we show that ecDNA-containing tumors impact four major biological processes. Specifically, ecDNA-containing tumors up-regulate DNA damage and repair, cell cycle control, and mitotic processes, but down-regulate global immune regulation pathways. Taken together, these results suggest profound alterations in gene regulation in ecDNA-containing tumors, shedding light on molecular processes that give rise to their development and progression.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Transcriptional immune suppression and up-regulation of double-stranded DNA damage and repair repertoires in ecDNA-containing tumors
- Date Crossref
- 19/06/2024
- Éditeur
- eLife Sciences Publications, Ltd
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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University of California San Diego Bioinformatics and Systems Biology Graduate Program pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Yonsei University Department of Biomedical Systems Informatics and Brain Korea 21 PLUS Project for Medical Science pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Howard Hughes Medical Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Dynamic Imaging (United Kingdom) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Dynamic Systems (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Stanford University Center for Personal Dynamic Regulomes pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Children's Medical Center pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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The University of Texas Southwestern Medical Center Children’s Medical Center Research Institute pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
Bioinformatics and Systems Biology Graduate Program — University of California San Diego, Department of Biomedical Systems Informatics and Brain Korea 21 PLUS Project for Medical Science — Yonsei University et Howard Hughes Medical Institute, avec 5 autres affiliations.
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