Macrophage and neutrophil heterogeneity at single-cell spatial resolution in human inflammatory bowel disease
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Le résumé fourni par la source
Ulcerative colitis and Crohn's disease are chronic inflammatory intestinal diseases with perplexing heterogeneity in disease manifestation and response to treatment. While the molecular basis for this heterogeneity remains uncharacterized, single-cell technologies allow us to explore the transcriptional states within tissues at an unprecedented resolution which could further understanding of these complex diseases. Here, we apply single-cell RNA-sequencing to human inflamed intestine and show that the largest differences among patients are present within the myeloid compartment including macrophages and neutrophils. Using spatial transcriptomics in human tissue at single-cell resolution (CosMx Spatial Molecular Imaging) we spatially localize each of the macrophage and neutrophil subsets identified by single-cell RNA-sequencing and unravel further macrophage diversity based on their tissue localization. Finally, single-cell RNA-sequencing combined with single-cell spatial analysis reveals a strong communication network involving macrophages and inflammatory fibroblasts. Our data sheds light on the cellular complexity of these diseases and points towards the myeloid and stromal compartments as important cellular subsets for understanding patient-to-patient heterogeneity.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Macrophage and neutrophil heterogeneity at single-cell spatial resolution in human inflammatory bowel disease
- Date Crossref
- 26/07/2023
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Consorci Institut D'Investigacions Biomediques August Pi I Sunyer pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Josep Carreras Leukaemia Research Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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SIB Swiss Institute of Bioinformatics pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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University of Zurich Department of Molecular Life Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Consejo Superior de Investigaciones Científicas pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Centro de Investigaciones Biológicas Margarita Salas pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Nanostring Technologies (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Boehringer Ingelheim (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Centre for Genomic Regulation pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Mútua Terrassa Department of Gastroenterology pays non établi dans la noticeInstitution
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Universitat de Barcelona pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Hepáticas y Digestivas, Consorci Institut D'Investigacions Biomediques August Pi I Sunyer et Josep Carreras Leukaemia Research Institute, avec 9 autres affiliations.
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