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Accès ouvert déclaré 2023 preprint

A Taxonomically-informed Mass Spectrometry Search Tool for Microbial Metabolomics Data

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57Institutions déclarées
15Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : us, br, Afrique du Sud, cr, ch, de, kr, gb, es, no, dk, at, mx, nl, sg. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Abstract MicrobeMASST, a taxonomically-informed mass spectrometry (MS) search tool, tackles limited microbial metabolite annotation in untargeted metabolomics experiments. Leveraging a curated database of >60,000 microbial monocultures, users can search known and unknown MS/MS spectra and link them to their respective microbial producers via MS/MS fragmentation patterns. Identification of microbial-derived metabolites and relative producers, without a priori knowledge, will vastly enhance the understanding of microorganisms’ role in ecology and human health.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
A Taxonomically-informed Mass Spectrometry Search Tool for Microbial Metabolomics Data
Date Crossref
20/07/2023
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • University of California San Diego Center for Microbiome Innovation pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University of Montana pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Universidade de São Paulo pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University of Denver Department of Chemistry and Biochemistry pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Virginia Tech pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Scripps Institution of Oceanography pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • University of Oklahoma pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University of San Diego pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University of Johannesburg University of Johannesburg, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
    Université ou école supérieure
  • Omnia (South Africa) Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
    Entreprise
  • University of Venda Afrique du Sud (code pays fourni par la source)
    Université ou école supérieure
  • Universidade Federal de São Paulo pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure

Center for Microbiome Innovation — University of California San Diego, University of Montana et Universidade de São Paulo, avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Afrique du Sud.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

Metabolomics and Mass Spectrometry StudiesGut microbiota and healthGenomics and Phylogenetic Studies

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