Enteropathway: the metabolic pathway database for the human gut microbiota
Rattachement africain : jp. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract The human gut microbiota produces diverse, extensive metabolites which have the potential to affect host physiology. Despite significant efforts to identify metabolic pathways for producing these microbial metabolites, a comprehensive metabolic pathway database for the human gut microbiota is still lacking. Here, we present Enteropathway, a metabolic pathway database that integrates 3,121 compounds, 3,460 reactions, and 837 modules that were obtained from 835 manually curated scientific literature. Notably, 757 modules of these modules are new entries and cannot be found in any other databases. The database is accessible from a web application ( https://enteropathway.org ) that offers a metabolic diagram for graphical visualization of metabolic pathways, a customization interface, and an enrichment analysis feature for highlighting enriched modules on the metabolic diagram. Overall, Enteropathway is a comprehensive reference database and a tool for visual and statistical analysis in human gut microbiota studies and was designed to help researchers pinpoint new insights into the complex interplay between microbiota and host metabolism.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Enteropathway: the metabolic pathway database for the human gut microbiota
- Date Crossref
- 28/06/2023
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Tokyo Institute of Technology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Research Organization of Information and Systems pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Database Center for Life Science pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Niigata University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Life Science and Technology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Omixer solutions pays non établi dans la noticeInstitution
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Graduate School of Medical and Dental Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Tokyo Institute of Technology, Research Organization of Information and Systems et Database Center for Life Science, avec 4 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.