Functional redundancy revealed by the deletion of the mimivirus GMC-oxidoreductase genes
Rattachement africain : fr, Maroc, ru, it. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract The mimivirus 1.2Mb genome was shown to be organized into a nucleocapsid-like genomic fiber encased in the nucleoid compartment inside the icosahedral capsid (1). The genomic fiber protein shell is composed of a mixture of two GMC-oxidoreductase paralogs, one of them being the main component of the glycosylated layer of fibrils at the surface of the virion (2). In this study, we determined the effect of the deletion of each of the corresponding genes on the genomic fiber and the layer of surface fibrils. First, we deleted the GMC-oxidoreductase the most abundant in the genomic fiber, and determined its structure and composition in the mutant. As expected, it was composed of the second GMC-oxidoreductase and contained 5- and 6-start helices similar to the wild-type fiber. This result led us to propose a model explaining their coexistence. Then, we deleted the GMC-oxidoreductase the most abundant in the layer of fibrils to analyze its protein composition in the mutant. Second, we showed that the fitness of single mutants and the double mutant were not decreased compared to the wild-type viruses in laboratory conditions. Third, we determined that deleting the GMC-oxidoreductase genes did not impact the glycosylation or the glycan composition of the layer of surface fibrils, despite modifying their protein composition. Since the glycosylation machinery and glycan composition of members of different clades are different (3, 4), we expanded the analysis of the protein composition of the layer of fibrils to members of the B and C clades and showed that it was different among the three clades and even among isolates within the same clade. Taken together, the results obtained on two distinct central processes (genome packaging and virion coating) illustrate an unexpected functional redundancy in members of the family Mimiviridae , suggesting this may be the major evolutionary force behind their giant genomes. One-Sentence Summary Functional redundancy preserves mimivirus genomic fiber and layer of fibrils formation.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Functional redundancy revealed by the deletion of the mimivirus GMC-oxidoreductase genes
- Date Crossref
- 28/04/2023
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Aix-Marseille Université pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Centre National pour la Recherche Scientifique et Technique (CNRST) UA13 BGE Maroc (code pays fourni par la source)Organisme public
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Institut de Microbiologie de la Méditerranée pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Department of Agricultural Sciences pays non établi dans la noticeOrganisme public
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University of Naples Federico II Department of Agricultural Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Inserm pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Commissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives pays non établi dans la noticeOrganisme public
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CEA Grenoble pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Université Grenoble Alpes pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Aix–Marseille University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Aix-Marseille Université, UA13 BGE — Centre National pour la Recherche Scientifique et Technique (CNRST) (Maroc) et Institut de Microbiologie de la Méditerranée, avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Maroc.
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