H2A.X mutants exhibit enhanced DNA demethylation in Arabidopsis thaliana
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Le résumé fourni par la source
Abstract H2A.X is an H2A variant histone in eukaryotes, unique for its ability to respond to DNA damage, initiating the DNA repair pathway. H2A.X replacement within the histone octamer is mediated by the FAcilitates Chromatin Transactions (FACT) complex, a key chromatin remodeler. FACT is required for DEMETER (DME)-mediated DNA demethylation at certain loci in Arabidopsis thaliana female gametophytes during reproduction, though it is not known how FACT targets DME sites. Here, we investigated whether H2AX is involved in DME- and FACT-mediated DNA demethylation during Arabidopsis reproduction. We show that h2a.x mutants are more sensitive to genotoxic stress, consistent with previous reports. H2A.X fused to the Green Fluorescent Protein (GFP) gene under the H2A.X promoter was highly expressed in newly developing Arabidopsis tissues, including in male and female gametophytes. We examined DNA methylation in h2a.x developing seeds using whole genome bisulfite sequencing, and found that CG DNA methylation in the developing endosperm, but not the embryo, is decreased genome-wide in h2a.x mutants, predominately in transposons and intergenic DNA. Hypomethylated sites overlapped 62 % with canonical DME loci. These data indicate that H2A.X is not required for DME function, but is important for DNA methylation homeostasis in the unique chromatin environment of Arabidopsis endosperm.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- <i>H2A.X</i> mutants exhibit enhanced DNA demethylation in <i>Arabidopsis thaliana</i>
- Date Crossref
- 09/01/2023
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
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Où se fait cette recherche
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Queen Mary University of London Genomics and Child Health pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Genomics (United Kingdom) pays non établi dans la noticeEntreprise
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University of California Department of Plant and Microbial Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Seoul National University Department of Biological Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Lawrence Berkeley National Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Joint Genome Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of California San Diego pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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North Carolina State University Department of Plant and Microbial Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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David H. Murdock Research Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
Genomics and Child Health — Queen Mary University of London, Genomics (United Kingdom) et Department of Plant and Microbial Biology — University of California, avec 6 autres affiliations.
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