Candida Genotyping of Blood Culture Isolates from Patients Admitted to 16 Hospitals in Madrid: Genotype Spreading during the COVID-19 Pandemic Driven by Fluconazole-Resistant C. parapsilosis
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Le résumé fourni par la source
Background: Candidaemia and invasive candidiasis are typically hospital-acquired. Genotyping isolates from patients admitted to different hospitals may be helpful in tracking clones spreading across hospitals, especially those showing antifungal resistance. Methods: We characterized Candida clusters by studying Candida isolates (C. albicans, n = 1041; C. parapsilosis, n = 354, and C. tropicalis, n = 125) from blood cultures (53.8%) and intra-abdominal samples (46.2%) collected as part of the CANDIMAD (Candida in Madrid) study in Madrid (2019–2021). Species-specific microsatellite markers were used to define the genotypes of Candida spp. found in a single patient (singleton) or several patients (cluster) from a single hospital (intra-hospital cluster) or different hospitals (widespread cluster). Results: We found 83 clusters, of which 20 were intra-hospital, 49 were widespread, and 14 were intra-hospital and widespread. Some intra-hospital clusters were first detected before the onset of the COVID-19 pandemic, but the number of clusters increased during the pandemic, especially for C. parapsilosis. The proportion of widespread clusters was significantly higher for genotypes found in both compartments than those exclusively found in either the blood cultures or intra-abdominal samples. Most C. albicans- and C. tropicalis-resistant genotypes were singleton and presented exclusively in either blood cultures or intra-abdominal samples. Fluconazole-resistant C. parapsilosis isolates belonged to intra-hospital clusters harboring either the Y132F or G458S ERG11p substitutions; the dominant genotype was also widespread. Conclusions: the number of clusters—and patients involved—increased during the COVID-19 pandemic mainly due to the emergence of fluconazole-resistant C. parapsilosis genotypes.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Candida Genotyping of Blood Culture Isolates from Patients Admitted to 16 Hospitals in Madrid: Genotype Spreading during the COVID-19 Pandemic Driven by Fluconazole-Resistant C. parapsilosis
- Date Crossref
- 21/11/2022
- Éditeur
- MDPI AG
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Hospital General Universitario Gregorio Marañón pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Instituto de Investigación Sanitaria Gregorio Marañón pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Respiratorias pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Research Institute Hospital 12 de Octubre pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Hospital Universitario 12 De Octubre pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Instituto de Salud Carlos III CIBER de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC) pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Centro de Investigación Biomédica en Red pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Hospital Universitario Ramón y Cajal pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Centro de Investigación Biomédica en Red Enfermedades Infecciosas pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Hospital Clínico San Carlos pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Instituto de Investigación Sanitaria del Hospital Clínico San Carlos pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
Hospital General Universitario Gregorio Marañón, Instituto de Investigación Sanitaria Gregorio Marañón et Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Respiratorias, avec 9 autres affiliations.
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